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186 个回答

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共线性分析,请问layout内容问题在哪里?

试一下把文件中最后一行空格删除。jcvi对文件格式要求高

回答于 2025-05-20 11:33

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共线性分析,最后一步出不来pdf。看不懂提示。

看截图日志信息是all.layout出现问题,检查一下文件内容

回答于 2025-05-20 11:22

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共线性分析出现如下报错,但是还是有结果。而且也能出图。这是怎...

warning 只是警告不是报错。这个是字体问题,不影响结果,可以忽略

回答于 2025-05-20 09:11

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blsatp,我想拿发表文献的基因ID的蛋白序列和我自己搜出来的序列...

截图中软连接pep.fa 指向的文件是不存在的,所以建库失败。check一下文件真正的路径

回答于 2025-05-16 09:35

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ParaAT批量比对,该怎么执行+X?

Epal2nal.pl 脚本文件,不要移动位置。要切换工作路径到Epal2nal.pl文件所在位置,并运行 chmod 命令。运行完成之后检查一下Epal2nal.pl文件权限是不是变成了(-rwxr--r--),这样就是Epal2nal.pl文件有执行x权限了。最后就切换工作路径到分析文件夹内运行分析命令

回答于 2025-05-16 09:18

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共享性分析图片美化像这样字体盖住了该如何修改绘图的代码?

可以修改代码中的半径参数,将圈图半径变小。或者用AI将染色体ID位置稍加移动

回答于 2025-05-14 14:05

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可以分析多个序列中两个序列的相似性吗?下图有多个序列,这么比...

想要找到序列相似的序列对,可以借助blastP工具,参考笔记:https://www.omicsclass.com/article/269。      1,文件建数据库。2,文件与刚才构建的数据库进行比对。

回答于 2025-05-13 17:25

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进化树制作,背景我设定的只是一段,为什么提交之后全部基因都有...

重点看一下GmNRNMP3b的分支,在最外群。选定这个支就是对全局进化支进行设置。这种情况下,可以单独设置GmNRNMP3b的分支,再设置其它分支

回答于 2025-05-11 12:38

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运行MCScanX查找共线性,java绘图出现错误为什么?

参考这个问题下的回答,https://www.omicsclass.com/question/7871 把ctl文件中的内容截图发一下。或者检查一下自己其它文件内容。应该是文件问题

回答于 2025-05-11 12:33

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在国家基因组下载的基因组信息是这样,请问下面这一步该怎么修改

外显子信息不用修改,基因家族分析课程中数据处理这步用不到这个信息。

回答于 2025-05-06 09:19