应该是文件内容有问题,可以看一下这个软件的示例文件怎么准备的
回答于 2025-05-06 09:17
#查看物种染色体 echo "800 1,2,3,4,5" >Arabidopsis_thaliana.circle.ctl 这步中应该是自己基因组的染色体ID
回答于 2025-05-04 14:21
无论是下载下来的该物种的全部代谢物,还是公司检出的,只要是识别到有ko号的,都可以放进来。 还有最终会生成富集分析结果表07.KEGG_enrichment_result.csv,里面有P值、矫正后的q值。一般P值就可以,如果想在绘图中展示q阈值结果,可以简单修改一下脚本。
回答于 2025-04-30 09:42
报错说 gff3_file_to_proteins.pl 脚本第84行的报错提示。根据Error, no sequence for Chr1的报错,可能是 $genome 变量下的Chr1染色体有问题,仔细检查一下
回答于 2025-04-17 15:02
seqkit grep 命令是 根据-f 选项文件中的 ID 提取序列。ID不一致不会提取出来,ID必须一致。
回答于 2025-04-17 13:54