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4143 个回答

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为什么在输入完保留蛋白编码基因后变成了这样,然后哪个命令是回...

NCBI上下载的基因组GFF文件格式不标准,导致程序出错,建议到其他网站下载基因组相关文件再试试; 

回答于 2023-11-01 14:12

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有多个时期的转录组数据,如何进行基因注释

把fastq文件cat到一起,比对一个bam文件即可; 

回答于 2023-11-01 14:09

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gatk call snp生成的vcf想要打开查看,提示是二进制文件?看不到...

压缩的,你解压一下试试;

回答于 2023-10-31 11:49

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请问这个

$gff 这个变量没有设置吧,你看看全面有没有命令漏掉了,没有运行;

回答于 2023-10-31 11:48

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请问蓖麻的dna序列和cds序列在哪下载

可以到一下基因组数据库查找下载:https://www.omicsclass.com/article/58 https://www.omicsclass.com/article/50 

回答于 2023-10-31 08:32

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老师您好,我根据教学指导试了很多次都不能将vcf文件转换成phy文...

用的是示例数据吗? 如果不是,自己的数据大,需要更多内存,这个可以设置一下:-Xmx5G 如果是windows中运行docker需要设置内存:https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2023-10-31 08:29

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老师如果有服务器的话,是不可以不用下载docker

可以,但是 你需要把要用到的软件都安装一下,并且添加到环境变量中,设置配置好; 有了docker就不用配置软件环境了;

回答于 2023-10-31 08:27

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老师,请教一下,用gatk call g.vcf.gz格式的文件是,运行中断了...

哪个样本的gvcf中断了,就从那个样本开始跑

回答于 2023-10-30 15:22

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报错pi_manhattan_plot.r command not found…

看看这个同样的问题:https://www.omicsclass.com/question/4971  加下可执行权限,那些脚本cd $scriptdir && chmod a+x *

回答于 2023-10-30 13:40

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gvcf合并成vcf文件

只能和前10的gvcf合并

回答于 2023-10-30 13:37