omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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测序数据比对

你这个是压缩文件，建议把文件后缀显示出来；这个windows没有好的办法，你先手动写命令吧；

回答于 2024-01-09 22:37

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这里有转换方法，你看看的：https://www.omicsclass.com/article/1885

回答于 2024-01-09 10:08

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用错镜像了吧，用基因家族2.0的镜像才有这个软件；

回答于 2024-01-09 10:06

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A GAT第二次运行需要把第一次运行的结果文件都删除才行；你这个提示我看不出问题，你删除所有结果文件再运行一下试试吧

回答于 2024-01-09 10:04

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新版的bedtools 不能有表头，你把文件的表头去掉试试的；

回答于 2024-01-08 12:03

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你这个vcf有的行没有这个参数，所以有提示，你看VCF文件吧；

回答于 2024-01-07 21:35

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你的GFF文件问题吧，这个网站没有UTR信息会自动把cds当作exon；你检查你的GFF文件格式问题

回答于 2024-01-07 21:34

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R脚本只是绘图，输入的就是nwk文件；你用nwk文件到 ITOL或者evolview在线网站手动编辑美化进化树吧：https://www.omicsclass.com/article/963

回答于 2024-01-07 21:32

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观察你的数据吧，不同的数据测序深度不一样，需要根据实际情况调整，过滤没了，建议降低过滤标准；

回答于 2024-01-07 21:31

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检查输入文件是否有问题，重点FAI文件染色体明着pvalue文件染色体是否一致

回答于 2024-01-07 21:30