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qiime2结果导出
镜像已经升级，请使用最新的镜像及课程分析数据：https://www.omicsclass.com/article/2371 如果使用老版本的课程，你看看你是不是用错镜像了；导致软件没有找到；
回答于 2024-04-11 08:21
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GWAS分析中，发现最显著的信号SNP的位置是在一个基因的同义突变...
由于与表型关联的SNP附近区域都具有连锁性；并不一定最显著的SNP是关键引起功能差异的SNP，例如，以下文章中起作用的就不是最显著的SNP； 红色箭头处
回答于 2024-04-10 09:34
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Plink可以计算IBD吗？
可以计算IBS： #plink 方法 ：plink IBS 方法检测离群样本：https://zzz.bwh.harvard.edu/plink/strat.shtml#outlier plink --vcf all.clean.vcf.gz --cluster --neighbour 1 5 --allow-extra-chr -out outlier_ibs --mds-plot 4 IBD计算不清楚
回答于 2024-04-09 10:11
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GATK 报错
vcf文件没有建立索引，你需要建立一下： gatk --java-options "-Xmx50g" IndexFeatureFile -I data.vcf.gz
回答于 2024-04-03 14:52