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4111 个回答

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单倍型分析中最后一步失败,麻烦老师

删除镜像,重新下载遗传进化镜像 ,这个最近更新了:https://www.omicsclass.com/article/2286

回答于 2024-03-15 14:01

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老师好 plink分析pca 一直报错

刚刚测试过没问题的: 可能由于系统原因,建议更换电脑试试,或者使用我们的云服务器:https://study.omicsclass.com/index

回答于 2024-03-15 14:00

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老师换了新的config3.txt,但是只出来了svg格式的图,没有png格...

看看文件里面的染色体编号是不是搞错了,Karyotype 参数对应这个文件里面的染色体编号和其他文件里面的核对一下;

回答于 2024-03-15 09:22

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在circos绘图时,最后一步不出图,显示出错误

config3.txt这个文件格式可能有问题,你打开看看看的检查检查

回答于 2024-03-14 17:52

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非模式物种建库进行GO和KEGG富集分析

近源物种没法做富集分析,建议构建自己物种的数据库再做富集分析,这里有分析方法:https://bdtcd.xetslk.com/s/29EigM

回答于 2024-03-14 17:50

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使用GATK的GenomicsDBImport合并gvcf导入db时报错Unexpected com...

检查这个文件上一步是否正确生成,如果没正常生成重新生成这个文件:BN14.g.vcf.gz

回答于 2024-03-14 17:48

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gvcf转换成vcf

没有报错信息或者中断,就是在运行中,这个时间久耐心等待;

回答于 2024-03-13 11:20

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在用cmscan进行ncrna注释的时候出现了segmentation fault (core...

系统版本导致的,需要重新编译软件才行; 可以使用我们的服务器:https://study.omicsclass.com/index

回答于 2024-03-13 10:18

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合并g.vcf

不用,重新运行这行代码即可;

回答于 2024-03-13 10:15

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水稻LD的衰减距离如何计算?

过滤SNP的时候应该过滤一下SNP cluster;你这个应该是么有过滤导致的,你可以在绘图的时候把距离太近的值去掉再做这个图; 这些在我们重测序课程和遗传进化课程里面都有讲解:https://bdtcd.xetslk.com/s/RCGWQ

回答于 2024-03-12 18:34