omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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ANNOVAR注释问题

看看运行过程中最后有没有报错吧，如果最后有killed字样就表示内存不够导致系统杀死了任务；

回答于 2024-04-19 11:09

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数据质控，一般测序公司会给质控好的；

回答于 2024-04-18 18:34

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我看命令行没有问题，可能你的电脑没有联网吧，你再试试的；

回答于 2024-04-18 18:33

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可以的，你可以先把双端的用flash 软件合并成单端的，再和单端的合并一起用qiime2 导入分析

回答于 2024-04-18 18:29

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理论上影响不大，因为引物也是扩增子的一部分，但是如果你的引物有简并，最好还是去除一下；

回答于 2024-04-18 15:24

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可以再检查看看的，可能你没看到吧；

回答于 2024-04-18 14:43

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需要先建GO KEGG注释库，之后才可以做富集分析这里有非模式物种KEGG与GO富集分析课程你看看的：https://bdtcd.xetslk.com/s/29EigM

回答于 2024-04-17 23:12

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有参数输入错误吧，你检查你的命令行：stagestage 分组列名写错了；看不到你的命令行无法指出错误；

回答于 2024-04-17 23:10

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没有更新这个软件，放心使用；

回答于 2024-04-16 18:13

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hifiasm 主要用pacbio ccs的HiFI测序数据组装，你的ONT的数据错误率高组装不出来；

回答于 2024-04-16 09:00