omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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在用tbtools计算基因对的KAKS时，出现了KS值大于1的情况，这种情...

没用过tbtools计算Kaks你可以了解一下kaks ：https://www.omicsclass.com/article/699

回答于 2019-04-30 12:40

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检查输入的fasta文件中染色体ID与位置中的染色体ID是否一致？如果一致，输入的基因位置信息也按不同染色体分成不同文件。

回答于 2019-04-29 21:08

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自己做的无参转录组组装的unigene吗？这个再NCBI上无法下载。

回答于 2019-04-29 21:03

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请使用我们百度云盘提供的最新biolinux：https://www.omicsclass.com/article/526 里面的软件都有安装。

回答于 2019-04-29 10:35

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脚本会把基因组文件都读取到内存当中，所以非常消耗内存，如果内存不够需要增加内存才行。电脑内存不够，为了防止电脑死机，系统自动杀死了任务：看看这个：https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2019-04-29 10:31

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这是由于你的gtf和参考基因组里面的染色体编号不匹配；检查是否下载错误的gtf 比如有的注释有问题，gff里面基因在染色体上的位置，比染色体都长等等，导致fasta序列提取错误。

回答于 2019-04-27 22:10

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下载下来对比看一下就知道了；我猜测chr应该是只包含染色体的基因；

回答于 2019-04-26 12:05

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可以看看这个如何计算qpcr的相对表达量：https://www.omicsclass.com/article/446

回答于 2019-04-25 16:28

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命令上传参考这个：https://www.omicsclass.com/article/398

回答于 2019-04-25 14:44

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当遇到上面情况的时候，或者一直黑屏进入不了biolinux，那是因为你的电脑CPU的虚拟化设置没有打开，应该到BIOS中设置打开一下，由于不同的电脑进入bios设置不同；可以参考这里：https://www.omicsclass.com/article/367

回答于 2019-04-25 13:26