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基因家族问题

这个和基因结构与染色体位置分析没有关系,你直接做就可以了; 更多基因家族分析可以观看视频教学:学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读

回答于 2019-09-05 14:41

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共线性

不知道你的基因家族共线性怎么跑出来的?  全基因组共线性又是用什么方法得到的? 如果两种不同的方法出现差异,可能某些参数设置有差异导致,属正常现象,以一种方法为准就行;

回答于 2019-09-04 15:35

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TC bit thresholds unavailable on model

hmm自己建立模型二次搜索为可选分析,没有必要不建议自己建立hmm模型再搜索;

回答于 2019-09-04 10:58

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-bash: SNP/S126-R132.HaplotypeCaller.log: No such file or di...

都已经提示了 最后的输出目录不对,你检查当前目录下有SNP目录吗? linux基础不好建议学习:linux系统使用

回答于 2019-09-04 09:21

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edger差异分析,如何查询分组差异的结果

结果应该在et这个变量里面,至于谁是对照不重要,最后看看结果表达量就知道了; R语言基础不好可以学习:R语言画图、R语言快速入门与提高

回答于 2019-09-04 09:18

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蛋白序列搜索

可以使用blast同源搜索,具体方法可参考基因家族分析课程:基因家族分析实操课程

回答于 2019-09-03 14:07

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如何将mRNA的ID和gene ID弄成一样的,就像拟南芥那样,要不然再...

可以学习perl语言批量自定义修改基因ID:perl入门到精通、perl语言高级

回答于 2019-09-03 10:02

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mRNA和gene ID不一致如何进行修改

不用修改,这样就可以分析;

回答于 2019-09-03 09:42

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GATK 输入gatk --list 后提示一下错误:Running:java-Dsamjdk.us...

不知道你使用的是什么命令,应该贴一下命令才好: 粗略搜索一下谷歌:https://github.com/broadinstitute/gatk/issues/4435  你可以参考试试; 

回答于 2019-09-02 17:58

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BSR-SEQ

没有遇到过这样的报错,这里有网上相关的问题:https://gatkforums.broadinstitute.org/gatk/discussion/7821/insert-size-out-of-range 可能是基因组染色体太大,应该用samtools index 建立bam索引才行; 这个没有测试过,你可以试一下; 

回答于 2019-09-02 17:57