mcscanX共线性分析软件可以做: https://www.omicsclass.com/article/275
回答于 2020-03-03 21:04
有些参数的意义要是弄明白了就可以融汇贯通,因为老师不可能把所有的都讲到,更多功能还是要看TCGAbiolinks的官方说明文档才好: 详情看:http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/TCGAbiolinks/inst/doc/download_prepare.html 这里你可以对应的改一下,应该就可以下载到你想要的数据了:
回答于 2020-03-03 09:43
TCGA拷贝数变异数据copy number variation 下载处理的方法不一样,你不要套用表达数据的下载方法: query <-GDCquery(project = "TCGA-ACC", data.category = "Copy Number Variation", data.type = "Copy Number Segment", barcode = c( "TCGA-OR-A5KU-01A-11...
回答于 2020-03-03 09:13
看你的文件应该没有问题,再检查一下文件结尾是否有多余的空行,有的话删除试一下; 如果还不行,建议使用我们提供的biolinux 里面安装了python 的mcscan,怀疑你的软件安装问题; https://www.omicsclass.com/article/526 基因家族分析课程:学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读
回答于 2020-03-02 20:02
电脑打开网易云课堂,课程的左下角有参考资料下载,所有的课程都检查一遍都下载下来; 有个打包文件解压之后里面有所有的脚步文件;
回答于 2020-03-02 19:55
电脑打开网易云课堂,课程的左下角有参考资料下载,所有的课程都检查一遍都下载下来; 有个打包文件解压之后里面有所有的脚步文件;
回答于 2020-03-02 19:55