你检查一下,你输入的序列里面是否有重复的ID;如果有重复的ID无法输入,你改一下ID使他们不同试一下; 也可以参考这个:https://www.omicsclass.com/question/1621
回答于 2020-03-05 11:51
生物信息分析主要占用cpu和内存,显卡普通就可以。 你现在的电脑做基因家族还可以,做高通量转录组数据最好还是用linux服务器;因为硬盘存储,还有内存不够用; macbook和普通的笔记本差不多,生物软件还是需要自己安装的,有些软件没有mac版本的也按不了; 正在要做生物信息分析需要linux服务器,哪怕一个小服务器也行...
回答于 2020-03-05 09:17
scaffold水平也是可以分析的,只是比较基因组部分分析不了,其他都可以分分析; 可以分析多个基因家族,或者相同的家族,不同的物种增加文章分析内容也不错:https://www.omicsclass.com/article/760 不同种类的家族特点不一样,有的家族比较保守,家族成员之间的序列相似度高,有的家族进化比较快,家族成员的序列差异大...
回答于 2020-03-04 18:12
https://www.omicsclass.com/article/526 看看这个下载对应的苹果系统的vbox就可以
回答于 2020-03-04 18:08
你可以自己编写程序去整理这些数据,perl或者python可以; 或者再看看其他地方有没有相同的基因组,ensembl 或者JGI等等,换个地方下载基因组; 生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提...
回答于 2020-03-04 13:09
建议选择组装完整的基因组,最好到染色体水平; 如果基因组上的基因蛋白序列没有,就没法做基因结构域分析了;建议选择注释完整的有GFF,cds,pep蛋白序列的参考基因组;
回答于 2020-03-04 11:17
二代测序转录组数据自主分析 这个课程学习需要有一定的linux基础,基础薄弱可能跟不上老师的课,建议学习:linux系统使用 你这个问题需要自行安装 hisat2软件,并且把软件的安装目录添加到环境变量PATH中才行; 更多生物信息课程,建议学习: 生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析...
回答于 2020-03-04 11:16