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比较基因组共线性作图疑问

更多的绘图设置可参考官方文档: https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version) 或者也可看看这个:https://www.omicsclass.com/article/506

回答于 2020-04-30 17:38

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这个虚拟化问题怎么解决?求指导啊

虚拟机安装参考:https://www.omicsclass.com/article/526 BIOS里面的虚拟化开启一下:https://www.omicsclass.com/article/78

回答于 2020-04-30 17:36

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求助:建库的时候显示 fa 文件不存在

输入命令的时候,看看是不是在中文状态下输入了;

回答于 2020-04-30 17:34

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怎么利用公开的转录组做基因家族的表达分析,还有GEO和SRA的区别...

GEO一般收录基因芯片的表达数据,但是也有高通量的测序数据上传到了GEO,具体的数据你需要查看说明; SRA为NCBI提供的专门收留高通量原始测序数据的一个数据库,好多杂志要求发文是公开数据那么作者一般会上传NCBI的SRA数据库; 一般做基因家族分析,最后可以利用转录组数据,看看基因家族成员的基因表达模式等等; 如...

回答于 2020-04-28 10:55

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MAGE建树问题

构建进化树输入的是序列的比对文件,你的文件就不是序列;报错正常的;

回答于 2020-04-27 11:08

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老师好,请问在做McscanX分析时,从gff提取的geneID与pep.fa文件...

建议不要从NCBI下载基因组,因为NCBI上的基因组会对基因ID,染色体等重新编号,使用起来非常麻烦; 你可以到其他地方下载基因组。

回答于 2020-04-27 11:07

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老师好,请问在做McscanX分析时,从gff提取的geneID与pep.fa文件...

不一样,你要是不懂脚本,就没法完成;你想办法弄一致吧

回答于 2020-04-27 11:06

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您好,我用cytoscape 的BinGO进行GO富集分析时,参照你们提供的...

ID里面不要出现特殊字符:比如/   修改下试试吧;

回答于 2020-04-27 11:05

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求解TCGA生存分析 数据分集createDataPartition错误

检查这个变量里面的数据是否有问题:

回答于 2020-04-27 11:03

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基因家族鉴定

你先了解一下自己的基因家族特点吧,多读读文献; 如果必须要5个结构域,你这种情况就删除

回答于 2020-04-27 10:50