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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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4091 个回答

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GDCdownload(query = query, directory = DataDirec...

改成 method='api'  换种方式下载数据

回答于 2020-04-24 13:17

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在R中进行差异表达分析,运行GDCdownload(query = query,...

method='api'  改成这个试试;

回答于 2020-04-24 13:16

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老师您好,在GEPIA中,可以进行TCGA和GTEX的对比分析,因为我研...

表达值可以使用 基因的counts值,批次效应可以参考:https://www.omicsclass.com/article/1113 不过都是真对GEO数据的,高通量测序数据不知道是否可行;

回答于 2020-04-24 13:15

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sratoolkit中prefetch下载一直报错是不是因为网的事情?

换个网络,或者试试其他方法吧:https://www.omicsclass.com/article/964

回答于 2020-04-24 13:13

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想问一下老师这个是怎么回事?

安装的 是docker desktop吗?   可能是网络原因,建议设置一下国内的镜像:https://www.omicsclass.com/article/1198

回答于 2020-04-24 13:11

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我想用cytoscape做相关性网络图,怎么按照微生物的分类水平区分...

你可以学习cytoscape软件以及微生物网络图绘制: OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程

回答于 2020-04-23 17:10

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bootstrap consensus tree导出nwk文件格式时Branch_lengths选项...

那你选择Original Tree吧,一样可以发文章的;

回答于 2020-04-23 17:09

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老师,麻烦问一下制作基因结构图时,gene_exon_info.gff文件始终...

ID 的名字要保持一致才行:

回答于 2020-04-23 17:08

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安装docker toolbox 报错:Looks like something went wrong in...

尝试方案 打开Docker Toolbox安装目录(默认安装在这里:C:\Program Files\Docker Toolbox),找到start.sh文件,找一个开发工具打开此文件,找出报错点。 发现如下图此处报错, 首先检查了下VBOX_MSI_INSTALL_PATH这个环境变量是否配置,但是奇怪的是这个环境变量已经配置,但是执行这个脚本的时候打印未发现此环...

回答于 2020-04-23 16:57

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老师,你好,我想问一下有没有一种购买方式,可以将组学大讲堂的...

组学大讲堂课程都在下面链接:可电脑点击浏览下面的链接分别购买,课程一般都是一年有效期(自购买日期): 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,...

回答于 2020-04-23 14:38