omicsgene
omicsgene - 生物信息
实名认证 专业认证

性别: 北京 - 北京市 注册于 2018-04-20

擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

生物信息

向TA求助
14702金币数
83160 经验值
454个粉丝
主页被访问 95722 次

4143 个回答

0 赞同

tassel新报错,求老师们看一下[Thread-8] ERROR net.maizegeneti...

内存不够吧,你看看这个 https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2023-08-18 06:38

0 赞同

基因注释文件gff第9列,ID标签和parent标签与蛋白序列和cds序列...

换个网站下载基因组,NCBI上的就是这样: 或者用这个:https://www.omicsclass.com/article/2032  新版基因家族课程已经更新这部分内容:https://bdtcd.xet.tech/s/1BAqPp 

回答于 2023-08-18 06:36

0 赞同

蛋白比对结果构建进化树_合并成supergene报错

显示 killed,你的电脑内存不够系统自动杀死了:https://www.omicsclass.com/article/1413 或者使用我们组学大讲堂提供的云服务器分析,避免内存限制:https://study.omicsclass.com/index

回答于 2023-08-14 18:26

0 赞同

我运行遗传群体进化的fst_pi_select_sweep.r这个脚本一直报错Err...

R 的版本升级了,你把这两行注释掉试试:

回答于 2023-08-14 11:33

0 赞同

想请教下老师,我在合并完受选择区域后进行基因注释的时候一直是...

输入文件都打开看一下,可能文件格式有问题

回答于 2023-08-14 11:32

0 赞同

请问进行基因家族鉴定分析需要准备哪些文件

我们有课程,里面有详细讲解:https://bdtcd.xet.tech/s/1BAqPp

回答于 2023-08-14 11:29

0 赞同

基因家族分析的文章被人提问为什么最长的基因对应的不是最大的蛋...

不知道你的文章怎么写的,审稿人怎么会问这个问题?

回答于 2023-08-14 09:27

0 赞同

进行bugbase运行时候老报错

输入的文件有问题吧,你对比下例子的文件

回答于 2023-08-14 09:26

1 赞同

基因结构信息统计脚本报错

建议用课程里面的,ATAG软件包处理一下,再用这个脚本统计, 不然可能由于GFF文件没有排序,格式不标准导致出差错; #保留蛋白编码基因agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl --gff  $database/homo_protein/osa.gff.gz --attribute biotype --value protein_coding -t '!' -o Oryza_sativa.protein_coding.gff3#...

回答于 2023-08-14 09:25

0 赞同

做选择清楚分析的时候,pi_manhattan_plot.r -i FS_C.windowed.p...

输入文件都截图看看的,文件之间染色体编号不一致吧,你检查一下;

回答于 2023-08-14 09:22