内存不够吧,你看看这个 https://www.omicsclass.com/article/1413
回答于 2023-08-18 06:38
换个网站下载基因组,NCBI上的就是这样: 或者用这个:https://www.omicsclass.com/article/2032 新版基因家族课程已经更新这部分内容:https://bdtcd.xet.tech/s/1BAqPp
回答于 2023-08-18 06:36
显示 killed,你的电脑内存不够系统自动杀死了:https://www.omicsclass.com/article/1413 或者使用我们组学大讲堂提供的云服务器分析,避免内存限制:https://study.omicsclass.com/index
回答于 2023-08-14 18:26
建议用课程里面的,ATAG软件包处理一下,再用这个脚本统计, 不然可能由于GFF文件没有排序,格式不标准导致出差错; #保留蛋白编码基因agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl --gff $database/homo_protein/osa.gff.gz --attribute biotype --value protein_coding -t '!' -o Oryza_sativa.protein_coding.gff3#...
回答于 2023-08-14 09:25
输入文件都截图看看的,文件之间染色体编号不一致吧,你检查一下;
回答于 2023-08-14 09:22