omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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跑PCR，为什么目的基因在各实验组中趋势相反？

你说的是PCR和转录组测序的基因表达量之间的差异吗？这个是有可能的，基因的表达是有时空特异性的，首先你的两次做的样本是否一致；不一致会有差异的；

回答于 2023-09-08 09:46

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表型数据一般不用处理，

回答于 2023-09-08 09:43

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你可以试一下，不排序如果不报错就没问题

回答于 2023-09-07 10:57

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没用过这个脚本，你再看看吧，或者到其他网站下载参考基因组文件

回答于 2023-09-06 09:24

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没用过这个脚本，你再看看吧，或者到其他网站下载参考基因组文件

回答于 2023-09-06 09:24

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输入文件格式有问题吧，你再对比一下示例文件

回答于 2023-09-06 09:23

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你这个是文件夹，不是压缩包文件，重新下载课程参考资料吧

回答于 2023-09-06 09:22

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检查 4个输入文件格式有么有异常吧，bed cds文件，ID是否对应等

回答于 2023-09-06 09:21

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基因组注释，建议用docker吧，里面有些软件不支持 singularity

回答于 2023-09-04 09:31

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ks>1 是有可能的，概念是这么定义的： Ka和Ks的计算公式： Ka=发生非同义替换的SNP数或者非同义替换位点数 Ks=发生同义替换的SNP数或者同义替换位点数但是会会考虑不同碱基之间替换发生概率不同，会用到不同的替换模型，因此不是简单的根据概念计算的；

回答于 2023-09-04 09:26