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kmer分析与最后组装基因组大小不同

kmer评估有误差,你检查是否评估错了; 组装看看去冗余是不是去多了; 真正想知道基因组大小建议做流式细胞;

回答于 2023-08-14 09:21

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关于基因组注释中mysql 语句创建用户的问题

可能用到的mysql版本不对,你自己手动加载课程资料百度网盘里面的mysql镜像试试的;

回答于 2023-08-14 09:19

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请问老师,我计算的测序深度1×才61.41% ,这个数值是很低嘛?课...

测序覆盖不均匀,数据质量不好

回答于 2023-08-14 09:14

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我在进行比对的时候就无论怎样都报错Warning: [Errno 2] No such...

文件路径有问题,你写出路径了,软件找不到文件

回答于 2023-08-14 09:14

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LTR_retriever结果问题

solo-LTR  这个分析没有,需要自己手动筛选才行;

回答于 2023-08-11 17:07

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docker怎么设置镜像以及内存,最后一张图是基因家族分析课程里面...

docker 内存设置方法:https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2023-08-11 08:44

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叶绿体基因组GetOrganelle组装时出现killed,程序终止。

内存不够超了,系统自动杀死任务了,你启动docker容器的时候内存多设置一些:比如  -m  50G 

回答于 2023-08-09 11:17

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hifiasm结果偏大怎么办,是什么原因呢

你这个相差太大,是不是基因组survery 做的有问题;多倍体建议用GenomeScope 2.0 评估,GenomeScope 1.0可能评估错误 在线评估网站:http://qb.cshl.edu/genomescope/genomescope2.0/

回答于 2023-08-09 09:10

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基因组注释:10.PASA_update,根据fa和gff文件生成pep或者cdna

输入文件路径不对,gff3文件和基因组fasta文件,路径不对, 你学习学习linux基础吧

回答于 2023-08-07 10:18

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老师,您好,RNAseq分析中,进行PCA分析时,为什么会有如下的报...

命令行用错了吧,你再看看例子的

回答于 2023-08-05 08:21