omicsgene
omicsgene - 生物信息
实名认证 专业认证

性别: 北京 - 北京市 注册于 2018-04-20

擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

生物信息

向TA求助
14702金币数
83160 经验值
454个粉丝
主页被访问 95721 次

4143 个回答

0 赞同

genome-annotation缺失tantan

我们的代码和镜像都是经过测试的;按照课程练习使用一般不会由于软件安装问题报错; 你这个可能是命令使用错误导致;

回答于 2023-09-21 07:23

0 赞同

注释脚本

基因组注释脚本在课程里面需要购买:https://bdtcd.xet.tech/s/2TnPfm

回答于 2023-09-21 07:21

0 赞同

在gwas分析中,单一线性模型没有问题,混合线性模型运行到30%就...

看看有没有结果,有结果就没事; 如果没结果,可能是电脑内存不够:https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2023-09-21 07:19

0 赞同

同一物种批量注释基因组

这个有些步骤可以简化的,比如 重复序列,有了repeat库,直接用这个库repeatmask注释就行;  基因注释可以用注释好的基因作为参考,

回答于 2023-09-20 20:25

0 赞同

mcmctree能否多线程运行?

不能多线程,只有单线程; 如果太慢建议用BV方法:

回答于 2023-09-20 10:35

0 赞同

水稻F2群体株高性状的GWAS分析模型选择GLM还是MLM

如果没有群体结构的话优先选择GLM; 也可以尝试MLM 具体可以看课程:https://bdtcd.xet.tech/s/2KgXQq 模型没有好坏,最适合自己数据的模型就是好模型; 各种关联模型都可以试一下,哪个关联的结果好选用哪个

回答于 2023-09-20 10:35

0 赞同

老师好,我在运行比较基因组学11.time_tree_BV脚本的时候,报错E...

对的,你再检查化石时间设置的

回答于 2023-09-18 12:07

0 赞同

quickmerge合并多个软件组装的基因组后,使用nextpolish去polish...

这个长度合并前后变化还没有关注过,变少了有可能哪里有问题, 你再检查检查数据的;看看合并之前两个组装结果的序列长度,然后再看看合并后的序列长度;

回答于 2023-09-18 08:10

0 赞同

安装docker 进行16S分析物种注释过程很慢

这个classifier需要内存很大,内存不够可能导致系统kill 内存和存储硬盘不是一个东西,你百度搜索一下补充知识; windows docker内存设置:https://www.omicsclass.com/article/1413 组学大讲堂云服务器即买即用,避免安装软件的麻烦和内存限制: https://study.omicsclass.com/ 

回答于 2023-09-18 08:06

0 赞同

老师好,我想问一下自己找公司测序得到的GB文件和fasta的文件跟N...

这个你看看需要自己做矫正,或者哪里有问题让公司做; 自己做矫正我们这里有叶绿体课程你看看的:https://bdtcd.xet.tech/s/2h9NgP

回答于 2023-09-18 08:04