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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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4143 个回答

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比较基因组学分歧时间脚本

输入文件有错误,你再看看视频课程的;

回答于 2023-09-17 10:19

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老师好,我在跟着课程实操时,运行gatk call snp时候,使用源代...

你的命令行写错了,看不到你的命令行,你自己检查检查的; 脚本前面有些变量需要设置,你记得运行设置;

回答于 2023-09-17 10:18

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GWAS分析中的PCA绘图识别不出来R脚本

请使用我们的docker镜像,如果自己配置环境,需要把R脚本第一行的Rscript 路径相应修改一下;

回答于 2023-09-17 10:17

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请教老师,Gemma分析时的报错问题?

输入文件不存在吧,你检查输入文件的

回答于 2023-09-16 07:46

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做群体进化和GWAS的R版本

你需要安装相应的R包即可; 命令截图不全,不知道你怎么运行的;

回答于 2023-09-16 07:46

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是否有利用paml中codeml计算正选择和快速进化基因的教程?

做正选择分析可以看看这个:https://wap.sciencenet.cn/blog-460481-1163040.html?mobile=1

回答于 2023-09-16 07:45

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老师您好,promoter.fa导出为空,是什么原因呢

电脑内存不够 杀死了吧;换大内存电脑;

回答于 2023-09-16 07:43

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基因组重测序,read比对到参考基因组时出现truncated file怎么办

数据不完整损坏了,重新下载原始数据

回答于 2023-09-16 07:41

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构建系统进化树

不排序 后面的 关联分析tassel可能会报错;你可以不排序试一下;

回答于 2023-09-14 18:14

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Tassel进行自己的GWAS分析中,自动分析pca时,不生成pca1~3文件

看你的输入文件挺大的,可能是电脑内存不够系统自动杀死了, 看看这个:https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2023-09-14 18:12