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单细胞转录组数据标准化：

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.08.18.456898v1.full

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omicsgene
发布于 3天前
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ggbio绘制基因结构图

基因结构图是基因组学研究中最基础的可视化之一，它能帮助我们直观展示基因的外显子-内含子结构；定位突变位点、SNP位点在基因中的位置；展示不同转录本的结构差异。ggbio是基于ggplot2开发的基...

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Ti Amo
发布于 4天前
阅读 ( 42 )

单细胞分析质控线粒体红细胞核糖体

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omicsgene
发布于 5天前
阅读 ( 66 )

SCP FeatureDimPlot 报错

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omicsgene
发布于 2025-09-04 15:48
阅读 ( 79 )

tensorQTL ：最高效的QTL 分析工具

tensorQTL ：最高效的QTL 分析工具用法介绍

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xun
发布于 2025-09-03 15:22
阅读 ( 110 )

cactus 软件：从基因组比到泛基因组分析

Cactus 是由 UCSC（加州大学圣克鲁兹分校）开发的全基因组比对工具（Whole Genome Alignment, WGA），采用层次化比对算法（Progressive Alignment），能够高效处理跨物种或同物种的基因组比...

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Ti Amo
发布于 2025-09-01 10:03
阅读 ( 241 )

IF=4.8 | 不同菊花品种萜类合成相关基因的转录组代谢组联合分析

“ 2025年2月 BMC Plant Biology杂志发表了一篇题为“Integrative transcriptome and metabolome analysis reveals candidate genes related to terpene synthesis in Chrysanthemum × morifolium...

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安生水
发布于 2025-08-29 16:09
阅读 ( 125 )

使用Copilot自动在Rstudio中写代码

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omicsgene
发布于 2025-08-15 15:57
阅读 ( 287 )

cactus-bin-v2.9.9 安装笔记

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omicsgene
发布于 2025-08-13 13:30
阅读 ( 246 )

NCBI 10X 单细胞原始数据下载解压注意：--include-technical

10X 单细胞原始数据下载

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omicsgene
发布于 2025-08-11 13:52
阅读 ( 301 )

feature 重要性排序棒棒糖图

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omicsgene
发布于 2025-08-08 16:00
阅读 ( 215 )

cactus下载

不同物种构建泛基因组的时候需要用到Progressive Cactus 参考文章：Dense sampling of bird diversity increases power of comparative genomic 下载：软件github：https://github.com/Comp...

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Ti Amo
发布于 2025-08-07 11:15
阅读 ( 258 )

seurat subset之后再聚类报错：

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omicsgene
发布于 2025-08-05 14:11
阅读 ( 183 )

CAFs 细胞类型细分

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omicsgene
发布于 2025-08-01 16:53
阅读 ( 304 )

linux fail2ban-server 服务添加信任IP

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omicsgene
发布于 2025-07-31 09:34
阅读 ( 375 )

deepseek绘图之--多组学相关性热图

在多组学分析中，经常需要绘制多组学相关性热图，用于展示不同组学数据(如转录组学、蛋白组学、代谢组学、微生物组学等)之间的相关性关系。这种热图可以帮助研究者发现不同层次生物分子之间的关...

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安生水
发布于 2025-07-30 18:18
阅读 ( 427 )

HISAT和STAR比对软件比较

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omicsgene
发布于 2025-07-25 11:32
阅读 ( 357 )

IF=4.2 | 不同西瓜品种果实品质的转录组代谢组联合分析

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安生水
发布于 2025-07-16 09:29
阅读 ( 570 )

SAW 空间转录组参考基因组制作

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omicsgene
发布于 2025-07-09 16:45
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cactus报错：Failed to get attribute: partialOrderAlignmentProgressiveMaxRows from cactus XML

报错：运行cactus-pangenome的时候报错： [MainThread] [I] [toil-rt] cactus_consolidated:ERROR: ERROR: Failed to get attribute: partialOrderAlignmentProgressiveMaxRows from cactus...