利用“xlxs"读取真Excel文件中的内容
对于科学问题,我们常常要找到差异,需要用到统计学检验,但是那么多统计学检验我该如何选择呢?
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PCA pcoa分析取舍
利用ggplot2绘制分组柱状图,并进行标签图例等设置。
参考基因组下载,Ensembl,NCBI,JGI等网站下载使用,可视化浏览,基因查看与下载等;
作为常用的正选择分析方法,计算Ka/Ks方法较为严格。本文介绍利用Sites Model方法来分析正选择基因。
时至今日,人类对生物总数还是没有明确的认识,本文介绍了多位科学家在生物总数评估上做出的成果。
ko、map等开头的代谢图有啥区别?里面的点、线、不同颜色都代表什么含义?看完这篇就懂啦!
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在基因家族分析中,有时候我们会想要知道我们所关注的基因家族在不同物种基因组间的同源性情况,或者只是简单的想要了解物种间染色体的进化关系,这时候就需要进行物种间全基因组的共线性分析,然后根据共线性分析结果进行可视化。今天我们就来教大家使用一款常用的共线性分析和可视化软件——MCscan,进行多物种的基因组共线性绘图。
在前一篇文章里写了使用OthroFinder软件构建物种同源基因分析的工作原理的介绍,这次就利用Orthofinder结果中的数据来绘制物种系统发育树(Phylogenetic tree)。 在Orthofinder结果文件中有一...
OrthoFinder 输出结果文件说明
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绘制进化树,是科研人的基础技能之一,而一张好看的进化树图,不仅能直观得展现基因或物种间的发育进化关系,更能增加文章的观赏性,赢得审稿人的青睐。今天给大家介绍的是一款非常实用且操作简...
解决老牌植物软件mapman出图的bincode与图上的binname不匹配
浏览器是科研工作者每天都要频繁使用的重要工具,但很多老师、同学的浏览器首页却仍是一个充满广告的、乱糟糟的网站。 为什么不能有这么一个网站?它提供文献检索、科研工作、生信分析常用的网址,同时页面简洁、美观、没有广告,专门为生命科学工作者定制!
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群体结构分析structure原理
APE是一款序列分析软件,可以对序列进行酶切位点预测、序列比对、引物设计、DNA序列翻译等等,用途是十分广泛,APE软件小巧快速,操作简单,下面我们一起了解一下它的功能! 1. 酶切位点预测...