SNP不能转化成CAPS标记？来试试dCAPS吧！
dCAPS是由CAPS标记衍生的分子标记。它是通过引物引入错配的碱基，从而构建或者去除限制性内切酶识别位点的标记技术
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- 安生水
- 发布于 2018-05-30 13:41
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安生水
R语言包安装方法，设置国内镜像加快安装速度
R 在线安装包，设置全局镜像，以免镜像不好链接中断 local({r <- getOption("repos") r["CRAN"] <- "http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/" options(repos=r)}) 或...
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- omicsgene
- 发布于 2018-05-16 21:31
- 阅读 ( 22749 )
omicsgene
rzx
R语言计算两组数据相关性及对应p值的方法——psych包和Hmisc包
1. psych包的corr.test()函数 2. Hmisc包的rcorr()函数
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- 星莓
- 发布于 2023-03-07 13:14
- 阅读 ( 20531 )
星莓
NCBI下载SRR并转换为fastq文件
想下载该篇文献中某一样品的fastq原始数据，看了一些下载教程，方法各异，看完思路还是不清晰，以下记录我的操作步骤，仅供参考
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- 星莓
- 发布于 2022-12-09 11:56
- 阅读 ( 13777 )
利用NCBI当中的CD-search工具预测基因的保守结构域
搜索鉴定基因的保守结构域，应该用专门搜索基因的保守结构域工具CD-search，而不是简单的用blast搜索注释。快速找到这个基因上的保守结构域，对研究基因的功能是非常重要的，因为行驶相同相近功能的基因往往具有相同的保守结构域！
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- omicsgene
- 发布于 2018-07-23 12:11
- 阅读 ( 86208 )
R语言对基因表达量数据RNA-seq做PCA分析
PCA(principal component analysis )主成分分析，可以分析样品之间相关性，确定样品总体上的差异，或者查看是否有批次效应等
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- omicsgene
- 发布于 2018-06-04 15:21
- 阅读 ( 30396 )
提取bam/sam文件指定区域reads
若想要从sam或bam文件中提取指定区域内的reads，可以使用samtools和bedtools来实现。 首先准备一个区域信息文件。region.bed #第一列为染色体ID，第二三列分别为起始终止位置 ...
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- 安生水
- 发布于 2018-05-18 09:34
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生信老顽童
加权基因共表达网络（WGCNA）寻找与疾病相关的hub基因
低成本发一篇sci，你也可以的！！！快来围观吧！
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- omicsgene
- 发布于 2018-04-20 19:22
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如何从GWAS结果中获取表型解释率PVE——TASSEL、GEMMA篇
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- 星莓
- 发布于 2024-01-11 14:09
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xun
如何预测蛋白质保守结构域？-InterPro在线工具使用详解
Domain-结构域分析是研究蛋白功能时不可或缺的分析项，那么如何去预测蛋白的保守结构域呢？以前我们给大家分享过NCBI提供的CD-search工具的使用，详情请点击链接学习：如何正确预测基因的保守结...
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- 红橙子
- 发布于 2022-01-19 21:53
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红橙子
你想桃子吗
转录组扫盲系列--reads如何比对到参考基因组上？
上一期给大家介绍了转录组建库原理：转录组扫盲系列--转录组如何建库？建完库下一步就是测序，测序原理讲起来其实很复杂，但是我觉得测序过程少了解一点对于理解转录组数据影响不是很大，下面有...
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- 红橙子
- 发布于 2021-04-26 19:13
- 阅读 ( 27912 )
