单细胞转录组数据挖掘流程记录-结直肠癌 CRC(GSE178341)

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  • 发布于 2024-07-25 11:01
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B/T细胞分类:

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  • 发布于 2024-07-25 09:50
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-结直肠癌 CRC(GSE146771)

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  • 发布于 2024-07-24 16:38
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-非小細胞肺癌(NSCLC)(GSE127465)

单细胞转录组数据挖掘流程记录-癌(NSCLC)(GSE127465)

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  • 发布于 2024-07-24 11:11
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biom格式的文件如何转化

biom格式的文件如果想要删除某个物种啥的,转换以后直接修改是不行的 先转化成tsv biom convert -i bak/feature_table_tax.biom -o feature_table_tax.tsv --to-tsv --header-key taxonomys l...

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  • 发布于 2024-07-23 15:29
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-肝细胞癌(HCC)(GSE149614)

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  • 发布于 2024-07-23 10:33
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-UM葡萄膜黑色素瘤(GSE139829)

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  • 发布于 2024-07-22 18:21
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R语言跑循环,如何跳过报错信息?

当使用循环跑R函数的时候,如果其中某一次循环执行时报错,那么就会中断循环体,并在屏幕上打印出报错信息

甲基化水平如何计算

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  • 发布于 2024-07-11 09:51
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add a Convex Hull with module

有的文章会在模块化的群落里加上Convex Hull ,类似这样,如何实现呢,可以借助ggforce的geom_mark_hul 比如我们的示例代码稍作修改 library(ggforce) 主要是加了最后一行,的geom_mark_hull...

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  • 发布于 2024-07-11 09:20
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pySCENIC转录因子分析结果解读

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  • 发布于 2024-07-09 12:05
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对水稻做GO和KEGG富集分析,如何获取水稻的数据库?

我们在使用clusterProfiler做GO富集分析的时候,需要在Bioconductor上下载目标物种的注释包

空间转录组数据预处理

​空间转录组简介 空间转录组,顾名思义,是在转录组的基础上加上了空间位置信息。如果不借助空间的技术,我们的转录组一般是粉碎组织到细胞层级或者更低的rna碎片层级,而进行sc RNA或者Bulk...

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  • 发布于 2024-07-02 15:56
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eQTplot包绘图报错解决:“Caused by error in `db_collect()`”

解决dbplyr和BiocFileCache不兼容导致eQTplot包绘图时报错的问题

单细胞转录组数据挖掘流程记录-CRC直肠癌(GSE178341)

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  • 发布于 2024-06-27 14:03
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-BRCA乳腺癌(GSE161529)

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  • 发布于 2024-06-27 13:48
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-BRCA乳腺癌(E-MTAB-8107)

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  • 发布于 2024-06-27 13:33
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-BLCA膀胱癌(GSE192575)

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  • 发布于 2024-06-27 11:44
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LD衰减距离

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  • 发布于 2024-06-27 09:50
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qsub任务投递系统的常用命令 SGE任务调度

qsub全称为”Queue Submitter”,是Sun Grid Engine (SGE)集群管理软件中的一个命令行工具。它的主要作用是将用户提交的任务加入到队列中,等待计算节点执行。qsub可在Unix/Linux等操作系统下使用...

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  • 发布于 2024-06-26 17:54
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