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RunUMAP函数报错,

执行降维分析的函数,umpa的时候报错 brain <- RunUMAP(brain, reduction = "pca", dims = 1:30) 报错信息如下: Error in irlba::irlba(L, nv = n, nu = 0, maxit = iters) : function '...

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xun
发布于 2024-07-25 14:15
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绘制全基因组甲基化图谱

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安生水
发布于 2024-07-25 14:08
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-结直肠癌 CRC(GSE178341)

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omicsgene
发布于 2024-07-25 11:01
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B/T细胞分类：

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omicsgene
发布于 2024-07-25 09:50
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-结直肠癌 CRC(GSE146771)

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发布于 2024-07-24 16:38
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-非小細胞肺癌（NSCLC）(GSE127465)

单细胞转录组数据挖掘流程记录-癌（NSCLC）(GSE127465)

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omicsgene
发布于 2024-07-24 11:11
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biom格式的文件如何转化

biom格式的文件如果想要删除某个物种啥的,转换以后直接修改是不行的先转化成tsv biom convert -i bak/feature_table_tax.biom -o feature_table_tax.tsv --to-tsv --header-key taxonomys l...

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xun
发布于 2024-07-23 15:29
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-肝细胞癌（HCC）(GSE149614)

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发布于 2024-07-23 10:33
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-UM葡萄膜黑色素瘤(GSE139829)

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发布于 2024-07-22 18:21
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R语言跑循环，如何跳过报错信息？

当使用循环跑R函数的时候，如果其中某一次循环执行时报错，那么就会中断循环体，并在屏幕上打印出报错信息

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发布于 2024-07-12 17:50
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甲基化水平如何计算

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安生水
发布于 2024-07-11 09:51
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add a Convex Hull with module

有的文章会在模块化的群落里加上Convex Hull ,类似这样,如何实现呢,可以借助ggforce的geom_mark_hul 比如我们的示例代码稍作修改 library(ggforce) 主要是加了最后一行,的geom_mark_hull...

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xun
发布于 2024-07-11 09:20
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pySCENIC转录因子分析结果解读

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发布于 2024-07-09 12:05
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对水稻做GO和KEGG富集分析，如何获取水稻的数据库？

我们在使用clusterProfiler做GO富集分析的时候，需要在Bioconductor上下载目标物种的注释包

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发布于 2024-07-05 14:39
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空间转录组数据预处理

空间转录组简介空间转录组，顾名思义，是在转录组的基础上加上了空间位置信息。如果不借助空间的技术,我们的转录组一般是粉碎组织到细胞层级或者更低的rna碎片层级,而进行sc RNA或者Bulk...

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xun
发布于 2024-07-02 15:56
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eQTplot包绘图报错解决：“Caused by error in `db_collect()`”

解决dbplyr和BiocFileCache不兼容导致eQTplot包绘图时报错的问题

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每天学习一点点
发布于 2024-06-30 09:52
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-CRC直肠癌(GSE178341)

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发布于 2024-06-27 14:03
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-BRCA乳腺癌(GSE161529)

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发布于 2024-06-27 13:48
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-BRCA乳腺癌(E-MTAB-8107)

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发布于 2024-06-27 13:33
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-BLCA膀胱癌(GSE192575)

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发布于 2024-06-27 11:44
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