scanpy 中 ScTransform分析:

scanpy 中 ScTransform分析:

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  • 发布于 2024-11-20 08:23
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seqkit | 对fa序列文件中序列长度进行筛选

seqkit seq -m 50 XX.fa > XX1.fa 将XX.fa文件中序列长度低于50的序列删除

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  • 发布于 2024-11-19 19:01
  • 阅读 ( 708 )

R 安装github包报错:

R 安装github包报错:

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  • 发布于 2024-11-18 15:42
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R公式中如何加入变量

expression()函数是没办法同时代入公式和变量,这个时候我们可以使用另一个函数来替代——bquote()

空间转录组数据读取

10x公司的空间转录组的数据一般有两种获取方式,第一是手里直接拿到有matrix和img文件(当然还需要对应的barcord和json等辅助文件),第二是公司直接提供或者从网络上下载到的原始数据,fq文件,那我...

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  • xun
  • 发布于 2024-11-13 16:56
  • 阅读 ( 1003 )

IF=13.8 | 甘油/二醇脱水酶是后肠发酵食肉动物肠道微生物群的关键功能

“ 2024年9月 BMC (BioMed Central)发表了一篇题为“Trait-based study predicts glycerol/diol dehydratases as a key function of the gut microbiota of hindgut-fermenting carnivores(Saccha...

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  • xun
  • 发布于 2024-11-13 10:44
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核苷酸多样性π的计算

核苷酸多样性(nucleotide diversity),记为π,是分子遗传学中一个重要的概念,可以作为一个群体遗传的重要指标去衡量种群的遗传多样度水平,也可以用在单个基因的多序列比对之中找到受选择的...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-11-12 18:14
  • 阅读 ( 2477 )

IF=13.8 | 青藏高原人群肠道微生物生物标志物的荟萃分析及微生物群衍生的丁酸盐在高海拔适应中的功能

“ 2023年9月 BMC (BioMed Central)发表了一篇题为“Meta-analysis identifying gut microbial biomarkers of Qinghai-Tibet Plateau populations and the functionality of microbiota-derived b...

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  • xun
  • 发布于 2024-11-12 18:10
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R语言基础入门—数据结构(2)

R语言基础入门—数据结构(2)

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  • 安生水
  • 发布于 2024-11-12 17:55
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R语言基础入门—数据结构(1)

R语言基础入门—数据结构(1)

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  • 安生水
  • 发布于 2024-11-12 17:50
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R语言基础入门—R语言概述与安装!

R语言基础入门—R语言概述与安装!

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  • 安生水
  • 发布于 2024-11-12 17:43
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eQTL分析之协变量计算

准备eQTL分析的协变量文件

Linux三剑客之grep-文件中的信息捕获

在Linux系统中,grep(Global Regular Expression Print)是一个用于在文本文件中搜索字符串或正则表达式的命令行工具。它可以有效地查找包含特定模式的行,并将其打印出来。今天,我们结合以下...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-11-12 17:36
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TWAS分析的原理和工具

TWAS(Transcriptome-wide Association Study)是一种用于研究基因表达和疾病之间关系的方法,通过对全基因组的基因表达数据进行统计分析,以识别与特定疾病或性状相关的基因表达变异。

Upset图绘制

Upset图绘制

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  • 安生水
  • 发布于 2024-11-12 16:27
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exFAT格式的硬盘挂载问题

我们在挂载ntfs格式的硬盘的时候,一般可以正常使用linux命令,不会有啥问题,但是如果硬盘格式是exFAT,会发现有很多问题,比如权限不能改 如何判断自己的硬盘的格式?比如位置在/dev/sdb2,用以下代...

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  • xun
  • 发布于 2024-11-11 17:22
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docker clash 配置

docker clash 配置

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-11-05 11:55
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-头颈癌(HNSCC)(GSE181919)

数据介绍: 来自谷歌翻译: 肝细胞癌(HCC)代表了肿瘤微环境与肿瘤发展之间关系的范例。在这里,我们为来自四个相关部位的 10 名 HCC 患者生成了超过 70,000 个单细胞转录组:原发肿瘤、门...

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  • 发布于 2024-10-31 14:05
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安装R包报错 fail to lock directory

这个错误通常发生在尝试使用R的install.packages函数安装新的包时。错误信息"fail to lock directory"意味着R不能锁定用于安装包的目录,这通常是因为之前的安装进程没有正确完成,导致锁文件(一个隐藏的文件,用于防止同时写入目录)仍然存在。

单细胞分析绘制marker基因展示图时如何设置细胞排布顺序

基因展示图时如何设置细胞排布顺序

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-10-29 09:47
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