老师，您好 在绘制转录本图时出现下列问题： 输入此命令：perl /home/manager/share/script/get_gtf.pl -in1 gene2_id.txt -in2 Gossypium_hirsutum_v1.1.gene.gtf -out u-box_gtf.txt，输出的 u-box_gtf.txt文件是空的，是什么原因？
获得基因家族结构域序列后，进行clustalw序列比对，出现错误。 我的结构域的序列为： 分步进行多序列比对 输入clustalw命令 选择1，输入文件 输入2进行比对 输入1 提示没有序列。
...gned和signed是不是选择的power值是不一样的呀，据说要乘以2？ 谢谢老师~
我们通过全基因组重测序对2个亲本和多个子代进行了测序，想通过该数据构建遗传图谱，但是看文章发现要先对亲本中缺失和杂合的SNP过滤，这个是如何过滤的？能不能和子代数据一起过滤？
ccs SRR.subreads.bam ccs/SRR.ccs.bam --noPolish --minPasses 1>|> 20190905 03:22:57.310 -|- FATAL -|- Runner -|- 0x7f3f365c8740|| -|- unsupported sequencing chemistry combination: binding kit: 100236500 sequencing kit: 001558034 basecaller versi...
统计下面文本中，第一列文本出现的次数（第2列没什么意义） gene 1cds 2gene 3gene 4rna 5cds 6 awk命令如下： awk '{sum[$1]++}END{for(i in sum) print i "\t" sum[i]}' example.txt 结果如下： cds 2rna 1gene 3
有一些问题想咨询下问题1：怎么判断自己跑出来qRT-PCR数据是否可用？①比如Ct值大小是否有要求？多少合适？②SD有什么要求？问题2：qPCR比较两组差异时t test应用paired还是unpaird
...分布在同一条染色体上，不需要考虑到基因之间的排布 (2) collinear 共线性(collinearity): 两个物种的几个同源基因分布在同一条染色体上，并且基因之间的排布方式相同 二者的区别如下图所示： 可以看到，synteni...
...延伸：DNA模板 --引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下，于72℃左右，以 dNTP为反应原料，靶序列为模板，按碱基配对与半保留复制原理，合成一条新的与模板DNA链互补的半保留复制链重复循环变性--退火--延伸三过程，就可获得更多...
...Rush就可以并行地为每个文本文件创建一个备份文件。 例2： seq 1 1000 | rush -k -j 8 'echo "Processing number {}"' 在这个例子中，我们首先使用 seq 1 1000 命令生成一个包含从1到1000的数字列表。然后，我们使用 rush -j 8 'echo "Processing number {...
1. 我下载了基因组注释的7个数据库（database.tar.gz.0到database.tar.gz.6），上传到服务器，cat database.tar.gz.* > database.tar.gz后，解压缩失败 2. 我换了一个电脑下载，换了一个硬盘上传，结果也是一样
...这样的序列，这是怎么回事啊？这样的该怎么解决呢？ 2. 为什么我根据视频里的教程提取出来的基因的位置信息，和我自己拿基因去NCBI寻找基因的位置出来的结果不一样而且差距很大呢？比如这个标记蓝色的基因，根据视频...
...能实现。输入转录因子的氨基酸序列即可，如下图所示：2. 预测的结果会很多，一般选择第一个，如下图所示：3. 查看位点详细信息，下载结合位点的特性信息， 可以预测转录因子调控哪些基因。
这是我用的命令 cd $dir/sfs awk '{ print $2}' $data/africa.group.txt | sort | uniq -c # 无外群，生成foldfs easySFS.py -i$data/Africadadi.vcf.gz -p $data/africa.group.txt -a --proj=74,56,60 -o./ ## 生成了3个群体的、以及三个群体两两之间的sfs文件 cd dadi/ mkdi...
在用omicsclass/genome-annotation镜像进行注释时报错，代码如下“funannotate mask -i pilon_polished2.fasta -o tz-mask.fasta”，提交后显示“Missing Dependencies: tantan. Please install missing dependencies and re-run script”。请问老师如何解决依赖项缺失问题