遗传图谱构建中群体SNP检测与开发

我们通过全基因组重测序对2个亲本和多个子代进行了测序,想通过该数据构建遗传图谱,但是看文章发现要先对亲本中缺失和杂合的SNP过滤,这个是如何过滤的?能不能和子代数据一起过滤?

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

你观察数据就知道了,SNP用VCF文件记录,你看看这个,写个perl脚本自己过滤一下就行:

https://www.omicsclass.com/article/847 

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