... 首先，要生成作图的输入文件，有脚本，用法如下： perl Correlation_analysis.pl -mirna Donkey_E_vs_Donkey_T.DEG.final.xls -DE_tar targets.final.xls -list bta.mir2target.list -out Correlation_analysis_input.txt 其中Donkey_E_vs_Donkey_T.DEG.final.xls是差异miRNA表达...
GST标签是什么？ 谷胱甘肽-S-转移酶(GST)是一个由211个氨基酸组成的大小为26kDa序列，它是另一种广泛使用的可提高靶蛋白的溶解度亲和标签。GST标签与固定化的谷胱甘肽具有亲和力，常用于原核表达。它可以与一个蛋白的N端或C...
如何从某一个文本文件中随机抽取一部分数据。譬如右下方这样的基因表达量数据的统计文件ref_trans_full_table.xls目标是由此文件中随机抽取一部分数据。 1、可以利用shuf获取随机数据，譬如随机选出其中的10个基因：（先获取...
非常感谢您上个问题的回复。还有一个问题关于 gama 射线引起的大片段缺失，gama 射线诱变 M0 野生型种子，单株收获并自交，此方法目前传递至 M10 代。对 M10 代 3000 份突变体进行瘤数增多的表型鉴定，对瘤数增多的稳定突变体...
方差分解分析（Variance Partitioning Analysis） 确定最佳环境因子组合之后，进行分解分析， #P+Hb+eGFRvpa <- varpart(otu, env['P'], env[c('Hb')],env[c('eGFR')],chisquare = FALSE)vpaplot(vpa, digits = 2, Xnames = c('P', 'Hb',"eGFR"), bg = c('blue', 'red',"orange")) ...
...://wkhtmltopdf.org/downloads.html】 工具全名叫 "wkhtmltopdf" ; 是一个使用 Qt WebKit 引擎做渲染的，能够把html 文档转换成 pdf 文档 或 图片(image) 的命令行工具。（强调一下：是 “命令行工具” ） 支持多个平台，可在win，linux，os x 等系统...
...要本科文凭了，就是辣么任性! 这位小神童名叫劳伦，个人履历是这样的： 4岁上小学，5岁小学毕业; 6岁上中学，8岁中学毕业; 今年刚好9岁，耗时9个月读完大学; 本来这位小神童很快就要拿到大学学位证了，但是他的父母...
老师您好，我测了4个不同发育时期的转录和代谢，现在主要想关注黄酮和酚酸，我想做一个WGCNA分析，找到跟黄酮和酚酸含量密切相关的基因。我需要准备哪些数据文件呢？（1）是将黄酮和酚酸代谢物含量数据放一起，还是分...
.../ 1. 下载MaxQuant软件： MaxQuant下载时需要先输入一个邮箱地址，Name、Email、Company是必填选项； 然后软件下载链接会放在邮件里 点击邮件里的链接即可下载软件压缩包.zip 2. 软件安装: 解压缩软件包...
...请问是什么原因？如何处理呢？另外，得到的exons.tsv和splicesites.tsv文件是空的，请问这种情况正常吗？ 运行代码：sh $scriptdir/index.sh Toona_sinensis.genome.fasta Toona_sinensis.gene.gff 报错信息如下：get gene length and gene.bed from gtf: RUN CMD: py...
...s，Fragments则是指每一段用于测序的核酸片段，在SE中，一个Fragments只测一条Reads，所以，Reads数与Fragments数目相等；在PE中，一个Fragments测两端，会得到2条Reads，但由于后期质量或比对的过滤，有可能一个Fragments的2条Reads最后只有...
...ut=FILE 将随机排序后的输出写到一个文件中 示例： 生成3个范围为1-100的随机数到文件rand.txt中 shuf -i 1-100 -n 3 -o rand.txt
...件 该基因qlen大概500多，然后我第一次hmm搜索只得到了35个片段，而其中又有很多是同一个基因的不同部分匹配到了 hmm模型的部分，都是很小的一分部，请问老师这样的话是否需要做构建该物种特异的hmm模型，如果想做的话，因...
...我在cytoscape中使用conet插件绘制互作网络图，我上传了两个文件，第一个文件是图一，第二个文件是图二，我不想用OTU的ID号做分析相，想做门水平的细菌，第二个表是抗性基因的数据，想观察抗性基因和门水平菌的共现性网络...
#! /usr/bin/python # -*- coding: utf-8 -*- import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np # Fixing random state for reproducibility np.random.seed(19680801) plt.subplot(211) #绘制一个两行一列的图，并对第一个图进行绘制 # 参考链接https://www.jianshu.com/p/de223a7921...