不知道为啥今天早上起来之后就一直在报错了，文件夹也是存在的，很迷惑
...比对，用featureCounts进行定量，得到结果文件上R进行差异分析，得到1300多个差异基因，gene_id转换时，差异基因从1300多到最后才900多（提取的Sus_scrofa.Sscrofa11.1.115.gtf和org.Ss.eg.db_3.22.0.tar.gz的entrez id和symbol合并到差异差异基因列表...
安装的时候，一切都很顺利，然后MCScanX对at的共线性分析也很顺利，但是在下游分析family_circle_plotter，报错了。再次回到MCScanX下去make的时候，不成功，报错为：Nothing to be done for 'default'.
...工合成，在基因敲除成功后，对测序结果进行基因表达谱分析、染色体DNA拷贝数统计等，最终实现从sgRNA设计、合成到功能分析的一体化服务。 目前定制人类全基因组CRISPR-Cas9文库筛选服务，还可免费使用人类全基因组gRNA敲除/...
序列的提取是我们生物学分析的基础操作，在许多分析中都会使用到。在这里给大家提供几个提取序列的命令。 1. seqkit 使用 seqkit subseq 通过指定区域提取序列 -r 通过区域来截取序列，提取 in.fa 前12个字符，可以用--chr指定染...
老师您好，我在跟着视频学习基因家族分析，做到基因家族基因在不同物种之间的进化同源关系这一步最后画图时，现如下问题： 我一共做了5个物种的比较，以下是我的文件内容截图： 我看主要是TAO和FN的基因在bed文件...
...o go back to main menuYour choice:我输入1,回车,结果1被删除,程序不运行,试了无数次都是这样,哪位知道这是为什么呀?谢谢了!
...，用我的继续下一步# 保留相似度100以及基因之间的最佳匹配 python3 $script/find_1vs1_v2.py last.txt 1vs1.txt结果显示错误：Traceback (most recent call last): File "/work/script/find_1vs1_v2.py", line 36, in <module> find_max_third_column(args.input_file, arg...
...细胞状态鉴定方面上表现优异。目前主要有R和python两个版本，支持分析人、小鼠和果蝇的数据。 1.1 pyscenic分析流程 1.1.1 构建共表达网络输入的数据是标准化的count矩阵（行是基因和列是细胞），从中找出TFs调节的基因构建...
生存分析（Survival Analysis）、Cox风险比例回归模型（Cox proportional hazards model）及C-index 1. 生存分析 生存分析指的是一系列用来探究所感兴趣的事件的发生的时间的统计方法。常见的有1）癌症患者生存时间分析2）工程中的失败时...
通过CNVnator获得的CNV文件，再通过SURVIVOR merge合并获得的VCF格式文件，如何做群体的进化树分析和群体结构，用mega软件的邻接法做不出来。最后问下可以做选择性清除Fst和Pi θπ分析 Tajima's D分析
...A数据挖掘，请学习的我TCGA系列课程： 《TCGA-甲基化生存分析》 《TCGA-生存分析》 《TCGA-基因差异表达分析》 《TCGA-ceRNA调控网络分析》 《TCGA-转录因子调控》
###使用本课程中如下代码跑自己的项目，出现问题，求老师解答： ## 热图展示物种丰度：选择相对丰度最高的前35个物种进行展示 #heatmap plot Phylum, Class, Order, Family, Genus, Species Rscript $scriptdir/abundance_heatmap.r --outdir abundance_heatma...
...ocker #设置开机启动docker服务docker version #显示 Docker 版本信息 docker info #显示docker安装信息 docker 镜像文件夹查看与修改：https://www.omicsclass.com/article/1183 普通用户要使用docker服务设置：设置非root账号使用docker服务：https:/...
...结了一下，大家其实想问的是：1，这个期刊审稿周期长不长?——我着急发文章啊!!!太久的我等不了啊!2，拒稿率是多少啊?——我不想做分母啊!我想一投即中行不行啊!3，接收以后要多久才能见刊?——我要凭正式出版文章评职称...