在官方示例中,进行模块保守性检测,作者用了3600个雄鼠基因和雌鼠的3600个基因。我有两类样本,每一类样本都进行了WGCNA分析,若这两类样本基因数目不一致,还能进行模块保守型分析么?
piranha输出的bed文件会把每一个bin给出一个p值,大部分bin的p值都小于0.01,要怎么筛选出显著的peak去找motif?如果一个peak跨两个bin,给出的p值是bin的而不是peak的,这种要怎么处理?
有人使用Excel时会不小心在单元格最后加个换行符,如果比较少,可以直接删掉,但是如果较多,一个个删就会很费劲。 这里有一种快速解决的方法。 1、选择要替换的单元格区域2、按CTRL+H快捷键,弹出查找与替换对话框3、...
...量基因表达数据的公共仓库。目前,GEO存储了大约10亿单个基因表达的数据,来自于100多种生物,内容广泛涉及到各种生物学问题。这些大容量的数据可以使用用户友好的以Web为基础的工具进行有效的挖掘,检索和可视化表达。G...
染色体的ID在图中无法展示全,我加了radius*=4000p的参数就变成第二个图,但是整体的字体缩小,看不清染色体的ID,无法一目了然,尤其是染色质刻度上。我在Circos官网上没找到,所以想问一下改哪个参数保证是第一张图的字...
...不同的参考基因组进行分析的,最终选择了差异较大的17个基因(不同基因组均有涉及的)进行验证,那GO分析的时候是利用差异基因进行分析,如果采用不同的参考基因组,GO的结果应该是受到影响的吧?但是不同基因组注释的...
...大是对tags数进行了抽平之后聚类生成OTU table,获得了1400个OTU物种。我们课题组拿到数据后进行了OTU过滤,过滤后保留了300多个OTU。这时样本OTU总丰度波动范围从2w到6w。在过滤后的OTU table基础上进行后续的分析(多样性,差异特...
想问一下,Genes、scientific reports、plos one、Horticulturae、Protoplasma、Frontiers in Genetics期刊,纯生信无实验验证的基因家族文章比较推荐投这六个期刊中的哪一个?投哪一个可以不用补实验,更容易中?
...是他的别称。他的泛用毋庸置疑,可非数学出生的计算这个还是颇为麻烦,因此我们用简单的python语言来实现卡方分布的计算,这个内容比较多,分两节说,这一节主要是基础语句首先看一下定义:假设k个随机变量相互独立,...
...。 抗CD19 CAR-T细胞可有效治疗R/R(复发性或难治性)B细胞恶性肿瘤,如儿童和成人患者的B细胞非霍奇金淋巴瘤(NHL)、ALL和慢性淋巴细胞白血病。CD19是表达于B细胞表面表达免疫球蛋白超家族成员,是CAR靶向治疗的理想靶点之...
我运行下面的你们给的代码 RepeatMasker -e rmblast -gff -xsmall -html -norna -source -no_is -pa ${threads} -s -lib allRepeats.final.lib contig.fa# -e rmblast 指定搜索引擎为rmblast,还可以选择crossmatch、abblast或者hmmer# -species "Danio rerio" 指定物种为斑马鱼...
treemix 老师您好,感谢您的课程,帮助到了我。 我有几个关于treemix的问题要问您: 1.关于做出来的图,我的图标太大了,跑到了图外面,根本显示不全;而且,字有重叠,不美观;似然树的红黄图标都压着主图了,想调到主...
...到最新的参考序列 qiime deblur denoise-other \ --i-demultiplexed-seqs demux-joined-filtered.qza \ --i-reference-seqs $dbdir/qiime2/unite_ver9_99_25.07.2023-Q2-2023.7.qza \ --p-trim-length -1 \ --p-sample-stats \ --p-jobs-to-start 10 \ --p-min-reads 1 \ ...
老师您好 我已经找到了我在chr1A,chr1B,chr1D上同源的一段序列,上面的基因也同源,我相用MCScan画这几个基因的共线性图。但是会报错 我的bed 文件和cds都没什么问题
GitHub 这几年国内普通用户越来越难以访问,github 作为全球最大的开源平台,里面有用的内容很多,不管是对专业用户还是普通用户,无法访问都是很严重的问题,使用频率高的直接拉到页面最下方使用自动更新 IP 方法,替换...