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文章 两个诺贝尔奖强强联合--CRISPR基因编辑的ESC/iPSC应用于再生和个性化医学

...C-Derived Platelets Depleted of HLA Class I Are Inert to Anti-HLA Class I and Natural Killer Cell Immunity. Stem Cell Reports, Vol. 14, 49–59, January 14, 2020. Gene Correction of LGMD2A Patient-Specific iPSCs for the Development of Targeted Autologous Cell Therapy. Molecular Therapy, Vol. 27...

文章 deepseek绘图之--微生物堆叠柱状图

...deepseek输出上面写好的提示词,如果问题复杂可以打开deepthink 这样简单的就不需要了 初步生成绘图代 给了详细的代码,我们来到rstudio运行一下结果如下 这明显出了问题,柱子不一样高,检查中文注释得知,他先计算了相对丰度...

文章 医学突破的先锋--CRISPR介导的HeLa细胞基因编辑 | 源井生物

...信号都显示出突变的TERT细胞产生了严重的细胞衰老。Annexin V和PI染色也提供了细胞凋亡的证据：突变的TERT细胞比WTPE-Hela细胞具有更高的凋亡率；在体外肿瘤细胞中缺乏TERT单链则导致细胞的生长迟缓和加速死亡。 图1：Tert+/-...

文章 IF=4.9 | 多倍体割手密IAA基因家族分析鉴定

​“ 2024年7月国际分子科学杂志(International Journal of Molecular Sciences)发表了一篇题为“ Genome-Wide Analysis of the Auxin/Indoleacetic Acid(Aux/IAA) Gene Family in Autopolyploid Sugarcane(Saccharum spontaneum)”的文章，文章鉴定了甘蔗野生种割手密(Saccharum ...

文章 一文教你绘制九象限图

... local({r <- getOption("repos") r["CRAN"] <- "http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/" options(repos=r)}) # 依赖包列表：自动加载并安装 package_list <- c("ggplot2","ggrepel","dplyr","devtools") # 判断R包加载是否成功来决定是否安装后再加载 for(p in package_li...

文章 必须收藏！比较基因组学分析必备神器-OrthoVenn2

...Qingyou Xia, Yi Wang. OrthoVenn2: a web server for whole-genome comparison and annotation oforthologous clusters across multiple species, Nucleic Acids Research, Volume 47, Issue W1, 02 July 2019, Pages W52–W58, https://doi.org/10.1093/nar/gkz333. 日常科研中你我经会常遇到看不懂的...

文章 docker 工具高级用法

...操作命令： > docker ps #查看后台正在运行的容器 CONTAINER ID IMAGE COMMAND CREATED STATUS PORTS NAMES a6c1ce4f6ae9 omicsclass/ampliseq-q2:v1.4 "/bin/bash" 24 seconds ago Up ...

文章 6个转录组发了BMC genomics，人家是怎么写的？

...的一篇3月12日见刊的题为“Transcriptomes analysis reveals novel insight into the molecular mechanisms of somatic embryogenesis in Hevea brasiliensis”转录组文章，内容难易适中，很有代表性，那就让我们一起看一看，6个转录组样本，每个重复3次，是如...

文章 R语言宽型与长型数据转换tidyr包

...th tidyrData Processing with dplyr & tidyrEasily tidy data with spread and gather functions

文章 同是转录组，人家发6分，你为什么发2分？

...成原因，作者分别于种子发芽后第6、7、8天（6 DAP, 7 DAP and 8 DAP；days after planting (DAP)）取腋芽组织进行转录组测序，通过对3个时间点基因表达情况进行主成分分析（PCA）发现phyB-1与野生型基因表达模式在6天和8天间分离现象明显...

文章 基因编辑iPSCS敲除技术原理与潜在的治疗应用

...类型。诱导多能细胞最早是在2006年由日本医师和研究员Shinya Yamanaka及其同事描述的。最初的实验是通过使用小鼠细胞进行的。然而，第二年，Yamanaka成功地从人成年成纤维细胞中获得了iPS细胞。在此之前，只能从早期人类胚胎...

文章 R语言计算两组数据相关性及对应p值的方法——psych包和Hmisc包

...函数的帮助文档也写到了 a numeric matrix with at least 5 rows and at least 2 columns (if y is absent). For print, x is an object produced by rcorr. 另外的一个知识点：如果想要用某个包里的函数，有两种办法， 第一种办法是先使用library()函数加载这个...

文章 linux用户管理命令介绍

本文总结了Linux添加或者删除用户和用户组时常用的一些命令和参数。1、建用户：adduser phpq                             //新建phpq用户passwd phpq                               //给phpq用户设置密码 2、...

文章 Bowtie2使用方法与参数详细介绍

对参考序列构建indexbowtie2-build genome.fasta index尝试使用前10000个reads进行比对bowtie2 -u 10000 -p 8 -x index -1reads1.fq -2 reads2.fq -S out.sam使用8个线程进行比对bowtie2 -p 8 -x index -1 reads1.fq -2reads2.fq -S out.sam比对的sam结果中添加了read group信...

文章 植物学家奇思妙想-改造基因组培育辣味番茄！

...西维索萨联邦大学的Emmanuel Rezende Naves等人在Cell子刊Trends In Plant Science（影响因子12.149）杂志发表了题为：Capsaicinoids: Pungency beyond Capsicum的论文，论文中作者详细梳理了辣椒素的生物合成机制，比较了辣椒和番茄的相似性，认为...