问题 最近用新生成的hmm文件做hmmsearch 报 TC bit thresholds unavailable的错，看您留言说已经解决了，请问您是怎么解决的呢？望您解惑，谢谢。

问题 请教下，我现在装了几个计算节点，我用管理节点切换到计算节点后，环境变量都变了，怎样使把管理节点账户的环境也能同步过去呢

问题 老师，请教一下，用gatk call g.vcf.gz格式的文件是，运行中断了，请问怎么样才能和之前跑的数据接着跑，而不是从零开始呢

问题 请问，用Evolview为树枝染色时，如果一个添加多个，只有第一个被染色，除非换行。怎么像教程里使用“mouse,human blue”一次染色多个不挨着的树枝呢

问题 ggplot，超过12种颜色，scale_color_brewer(type="seq",palette="Paired", direction=-1)+ 颜色不够用

老师，我有19个样本，但调用scale_color_brewer时只有12种颜色，导致我的点线图里有七个没有颜色，这种情况应该怎么办？ p_line_point = ggplot(dat, aes(x=dat[,2],y=dat[,3],shape=dat[,1],color=dat[,1]))+  geom_line(size=1)+  scale_color_brewer(type="seq",pa...

文章 GST标签纯化蛋白的优劣势及常见问题解析

...蛋白的方法。GST可作为一种可溶性蛋白在大肠杆菌细胞质中大量表达，并具有完全的酶活性。此外，许多在大肠杆菌中表达时不溶的真核蛋白，在表达为GST标签蛋白时被证明至少部分可溶。   GST标签纯化蛋白的优劣势： 优势...

文章 研究生怎样才能和导师打成一片？

...的现象，但是出现了就要解决，不要一味抱怨，这样解决不了问题。 其实人都有缺点，包括研究生导师，要学会谅解和换位思考， 而且导师带过这么多的学生了，他/她自己可能也在慢慢成长中。 5，做好故障排除准备 你的...

问题 请问老师，进化树中original和bootstrap树有什么不同，同源性最大的一个基因应该怎么看，两次用相同基因做进化，为什么距离最近的是不同的基因

问题 进行基因家族成员鉴定的时候，是不是在hmmsearch搜索后，只要用CDD或Pfam鉴定出含有该基因家族的保守结构域，就可以认为该基因属于这个家族吗？

问题 老师，用MEGA构建进化树时，是删掉每个序列的所有gap，还是在删除gap的同时要保证各序列对齐？像下面这种情况，删不删除该区段的gap呢？

问题 虚拟机挂载共享文件夹出错了，请问之前上课给的虚拟机bio-linux不能用了吗？如果改用docker，那么Win7系统的能用吗

文章 seqkit根据序列ID筛选fasta文件

...CUUUCCU#多次使用$ zcat hairpin.fa.gz | seqkit grep -r -p ^hsa -p ^mmu -v#根据ID提取序列$ seqkit grep -f id.txt seqs.fq.gz -o result.fq.gz # ignore case $ seqkit grep -i -f id.txt seqs.fq.gz -o result.fq.gz 更多使用方法见：https://bioinf.shenwei.me/seqkit/usage/

问题 采用RSeQC 对bam 文件进行质控分析时，用inner_distance.py报错。

...在学习转录组数据自主分析，在第11课实验质量评估，采用RSeQC 对bam 文件进行质控分析时，用inner_distance.py报错。 报错信息： manager@bl8vbox[QC] inner_distance.py -i /home/manager/rnaseq/work/3.alignments/hisat2/UHR.bam    -r stringtie_merged.bed  -o UHR...

文章 KEGG数据库-蛋白序列文件下载

...析。 虽然KOBAS 也提供pathway 相关的信息，但是该数据库中没有提供KEGG 的KO编号，不好操作，这个可以采用KEGG 的API解决,我们下篇文章再讲 虽然KOBAS 网站是在国内，但是该网站的服务不太稳定，经常无法访问。

问题 报了基因家族鉴定的课，之前装ova的时候用的是官网的，但是很多软件没有。现在想重新装一下课程提供的含软件的ova。请问应该如何处理？