问题 二代DNA测序数据进行kmer分析，结果如下图，想请问可能的原因和建议。

问题 请问利用jcvi整理泛基因列表，做JCVI做共线性分析时，一直提示/bin/bash: lastdb: command not found，是没有安装Last软件包吗？目前使用的镜像是购买课程时老师提供的，数据是26个玉米基因组数据（由于空间不足，只用了19个基因组）

文章 一行代码检查GWAS分析中表型数据的错误

在进行GWAS分析时，如果表型数据出现了数字或NA以外的其他字符，在分析时就容易报错。 但是表型性状一般都信息非常多，肉眼难以检查出错误，那接下来带大家用一行代码来检查表型数据的错误。 随机构建一个表型数据如...

问题 blast2go本地化过程中，导入数据库不全，请问老师是哪一个数据库出了问题？我还想要一份无参GO注释的流程或者手册之类的，谢谢

...b2gdb这个文件下并没有作者显示的这么多，请问是哪一个数据库我导入出了问题？有没有无参GO注释的流程或者手册之类的推荐一下？ mysql -s -uroot -p密码 b2gdb < go_monthly-assocdb-data mysql -uroot -p密码 b2gdb -e "LOAD DATA LOCAL INFILE '/root/...

文章 PlantPAN数据库

...简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

问题 我的转录组数据与参考基因组比对后发现基因间区及内含子比例较高，是怎么回事？

我的转录组数据分析发现基因间区及内含子比例超过了30%，是不是很高，一般是多少？是什么原因造成这两类比例高？

问题 老师，请问在STRING数据库中没有丹参，怎么把互作网络中的拟南芥名称改成丹参的呢？

由于STRING数据库中没有丹参，所以搜索的时候选择了拟南芥。

问题 在T2T基因组直播课程中基因组hic挂载染色体部分，老师说对于高杂合基因组还需要用一个软件过滤等位基因假信号，是什么软件，我没听清；还有个问题如果只用nextdenevo进行数据校正不组装，那么校正后的数据在哪个文件夹？

问题 单细胞测序数据做聚类分析后图片聚类结果不清晰且很丑，应该调整哪些参数？怎么调整？

老师好！单细胞测序数据做聚类分析后图片聚类结果不清晰且很丑，应该调整哪些参数？怎么调整？

文章 blastn使用教程及结果详解

...stdb -in genome.fasta -dbtype nucl -parse_seqids -out ./index -in：构建数据库所用的序列文件。 -dbtype：数据库类型。构建的数据库是核苷酸数据库时，dbtype设置为nucl，数据库是氨基酸数据库时，dbtype设置为prot。 -out：数据库名称。 2.序列...

问题 关于细菌illumina测序数据demultiplex的问题

老师好，qiime cutadapt demux-paired把我原本有数万个的样品弄得只剩下了几千个。请问是哪出了问题？ 可以看到，除了71这个样品之外，我其他三个样品只有几百到两千个count了。而我的样品应该是有几万个到十几万个count的，就...

问题 在mapman里，我要导入数据，但我的DEG文件，但有些数值是Inf 有些是-Inf,要用什么代替呢？

老师： 您好！在mapman里，我要导入数据，但我的DEG文件，但有些数值是Inf  有些是-Inf,要用什么代替呢？望指教

问题 vennerable 三维及以上如何实现按数据大小比例并自定义配色方案

再利用vennerable包VennThemes函数时，我不知道怎么分face，因为三维及以上，其交集的个数很多，请教大家一下！

文章 基因芯片小知识

...经成为生物领域十分有用的工具。然而，芯片实验产生的数据量日益增长，由于不同的分析方法，会得出不同结论，因而分析起着关键作用。 基因芯片分析就是为了通过生物信息学方法从这些芯片数据中发现可能对生物效应...

问题 老师，请问在STRING数据库中没有丹参，怎么把互作网络中的拟南芥名称改成丹参的呢？

由于STRING数据库中没有丹参这个物种，所以我在搜索的时候选择了拟南芥。