单细胞测序数据做聚类分析后图片聚类结果不清晰且很丑,应该调整哪些参数?怎么调整?

老师好!单细胞测序数据做聚类分析后图片聚类结果不清晰且很丑,应该调整哪些参数?怎么调整?

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

可以用R语音读入RDS 文件手动修改输出PCA图片:https://satijalab.org/seurat/reference/dimplot

library(Seurat)
pbmc=readRDS("pbmc.rds")
DimPlot(object = pbmc,reduction='pca')
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  •  提出于 2024-05-13 09:07