在T2T基因组直播课程中基因组hic挂载染色体部分,老师说对于高杂合基因组还需要用一个软件过滤等位基因假信号,是什么软件,我没听清;还有个问题如果只用nextdenevo进行数据校正不组装,那么校正后的数据在哪个文件夹?

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Ti Amo

高杂合基因组没有提及,只说了高度重复的话需要用ALLHIC的 prune这一步

nextdenevo数据矫正结果在 输出文件夹/02.cns_align/01.seed_cns.sh.work/seed_cns*/cns.fasta

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  • 陈黑手 提出于 2024-11-27 17:53

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