...学大讲堂提供的扩增子分析docker镜像(v1.4)使用的qiime2 版本为:Qiime2.2020.8版本。目前qiime2的最新版本为2022.8,相较于2020.8版本有很多大的更新,更新信息如下: 扩增子docker镜像更新说明 为使大家使用上最新的qiime2软件,我...
...析: 好了,到这里我们就结束了,想了解MCscan python版本的更多内容,可以查看MCscan 官网:https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version) 6. 共线性结果说明 1.基因组共线性详细结果文件,过滤掉不可靠的共线性区块...
...),已经无法匹配现有的蛋白序列文件(下图右)了,老版本蛋白序列文件已经删除,只剩cds和gff文件。 新版本的基因和蛋白ID命名与老版本相比已有较大改动,感觉联系不是很大。(基因组网站是文献给出的) 请问在这种...
如截图中表格,有一个没有含有目标结构域,那这个基因怎么被快速找到呢?
在用stringtie进行转录本组装拼接定量后,从服务器上下载定量后的文件t_data.ctab文件,打开后发现gene_names一列没有基因名字,在R中用ballgwon包进行差异基因筛选后发现,同样没有基因名字,这是为什么呢?我的参考基因组和注释...
...,请检查安装并重试。 出现报错的原因: 1. javac与java版本不同所致,可以采用以下方法进行检查。如果真的不一致就安装或者指定一个一致的。 javac -versionjava -version 2. 安装了多个版本的JDK,可以把不匹配的都卸载了,留...
VScode有一个文档列对齐的插件: 该插件可以根据不同的符号,甚至正则表达式作为列分割符号实现文档的列对齐,对于文档阅读很友好,下载地址: https://marketplace.visualstudio.com/items?itemName=cpmcgrath.Codealignment 插件不同符号...
...种目前参考基因组刚刚公布,转录组和全基因组的id并不匹配。我准备做的是WRKY家族,现在打算是用拟南芥钓出来的我的物种的WRKY蛋白序列(全基因组),然后用我的WRKY蛋白序列再去转录组蛋白序列中钓WRKY蛋白序列,用钓到的...
1.StatET插件来源及安装要求: 官网地址:http://www.walware.de/ 插件地址:http://download.walware.de/eclipse-4.6 2.安装步骤: 手动添加地址安装,点击菜单栏 help>Install New Software: 选中要安装的插件: 然后就可以安装完成。 3....
...件的安装和使用稍微有一点麻烦。其实,circos图也是可以在线绘制的,这样就简单多了!一起来了解一下吧! 在circos官网(http://circos.ca/)的最右方有个“CIRCOS ONLINE”选项,这里可以实现在线绘制部分circos图。 打开后界面如...
能传我CoNet和cytocluster这两个APP的插件吗,我的电脑没法下载