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问题 您好,我cytoscape 的BinGO进行GO富集分析时,参照你们提供的无参 GO注释的demo, 怎么运行不了?请您指教

这是您的教程,https://www.omicsclass.com/article/339  ,我做的是非模式植物的,你们的demo,准备GO 注释数据,(species=sss_aa)(type=consortium)(curator=GO) i0_HQ_W_c10162/f2p0/728 = 0015078 i0_HQ_W_c10176/f5p0/771 = 0006457 我这个格式有错吗? 谢谢, 照你...

文章 Excel图表保存成高清图片

...求设置。 选Excel的数据图表(例如柱状图)复制(Ctrl + C),进入 Ai直接粘贴(Ctrl + V),之后选择文件存储为PDF、EPS、SVG等格式,EPS文件保存时注意设置格式:TIFF(8位颜色)。 注:保存后的文件可再次借助Ai编辑,并...

问题 想请教一下,我是基于windows+docker做的宏基因组注释,然后在去宿主这一步,卡住了 不知道为啥 一直不动

问题 课程自带网页上的RStudio 打不开sh文件了?公司课程问题为啥也一定要发布才能解答呢?那花钱进的群意义是什么呢?

问题 提取出来的泛基因也太少了,这样对吗?泛基因编号不是说两个以上基因组才有编号吗,为啥只有一个呀

是因为只了domain1,domain1的基因太少了吗?如果这种情况的话,分析还有意义吗?

文章 从NCBI当SRA数据库下载高通量测序数据

...法下载数据需要经过复杂的设置,而且经常莫名奇妙的下不了,总的来说体验很差。 其实老朋友迅雷也是可以下载的 下面通过一个例子介绍如何迅雷下载SRA数据: 例如,我们要下载SRP108428(阅读文献可以找到公开数据的p...

文章 GATK4进行变异检测是否可以多线程

...-nct来设定多线程运行,但是GATK4却没有类似的参数,这是为啥呢?早有研究者问过GATK的团队,官方的回答简单粗暴,没有! 话虽如此,但GATK团队实际上还是留下了唯一的一个例外!那就是HaplotypeCaller最消耗计算资源的模块...

文章 群体遗传进化分析MEGA

...获得类似下方的结果(基于K2P,和Ts +Tv): 按照图片指示的位置可以将结果保存为指定格式。 第三步:Phylogeny 利这一步分析可以得到序列之间的系统发育树,这里需要选择不同的计算算法,之后要进行distance计算...

文章 提取 VCF 文件的基因型信息

VCF 是一种常的生物信息学文件格式,于存储基因组的遗传变异数据,特别是单核苷酸多态性(SNP)和小插入/缺失(Indel)等变异。 VCF 文件通常由文本格式组成,可以文本编辑器进行查看和编辑。每个 VCF 文件通常包含...

文章 317名研究生被退学?多半是自己作的

没有毕不了业的研究生? 这一切,终将成为历史。 一起来看看“蝴蝶效应”: 二月份翟天临事件——教育部要求加强管理——院校对“浑水摸鱼”的研究生进行清退处理——广州大学退学了72名研究生——深圳大学的“大放血...

问题 重测序

...参数的都是参照的课程的默认的。请问是什么问题呢?为啥会出现这种情况?我接下来具体应该怎么做呢?

文章 最好的测试管理工具是什么?

...点点的操作。 亮点四:测试例批量执行的功能肯定少不了,你需要的它都有哦。 亮点五:例执行页面执行操作简单明了,还可以记录下了执行过程发现的缺陷,执行人员的操作记录,一目了然 六、缺陷管理 1、缺陷...

问题 请老师帮忙看看为啥一样的操作,将anchors.simple更新了基因家族的数据进去就做不出来图了,不添加基因家族信息可以作图,而且名字改了 对应的mcsacn.layout 也改了

文章 Linux生物信息分析环境搭建

...知道怎么入门?先来搭个环境吧!想分析数据,但是分析不了?先来搭个环境啊!搭建好环境,后面的自然就简单多了。 我们平时大都会使Windows,而很少使Linux,然而做生物信息分析是需要Linux的啊,而且听人说安装Linux...

问题 linux读取文件出错

经常在运行cat,head,blast等命令时出现Input/output error报错,有些文件之前过没问题,现在就不了了。