问题 hmmer搜索结构域

...一步时遇到一个问题，我已经验证过每个基因在CDD数据库中都有WRKY结构域和锌指结构，但是后面做到蛋白质全长多序列比对分析用GeneDoc查看结构域时发现有些基因结构域不全，好多基因都没有锌指结构显示，我怀疑是 #截取得...

问题 您好，我用cytoscape 的BinGO进行GO富集分析时，参照你们提供的无参 GO注释的demo, 怎么运行不了？请您指教

这是您的教程，https://www.omicsclass.com/article/339  ，我做的是非模式植物的，用你们的demo，准备GO 注释数据，(species=sss_aa)(type=consortium)(curator=GO) i0_HQ_W_c10162/f2p0/728 = 0015078 i0_HQ_W_c10176/f5p0/771 = 0006457 我这个格式有错吗？ 谢谢， 照你...

文章 Excel图表保存成高清图片

...求设置。 选中Excel中的数据图表（例如柱状图）复制（Ctrl + C），进入 Ai直接粘贴（Ctrl + V），之后选择文件存储为PDF、EPS、SVG等格式，EPS文件保存时注意设置格式：TIFF（8位颜色）。 注：保存后的文件可再次借助Ai编辑，并...

问题 基因家族基因组内共线性分析时，鉴定到5对大片段复制基因，为啥在圈图里只有4条红线？

问题 ka/ks利用课程脚本输出了一对完全一样的串联重复基因但mcsacnX做图时为啥没显示串联重复基因

文章 从NCBI当中SRA数据库中下载高通量测序数据

...法下载数据需要经过复杂的设置，而且经常莫名奇妙的下不了，总的来说体验很差。 其实老朋友迅雷也是可以下载的 下面通过一个例子介绍如何用迅雷下载SRA数据： 例如，我们要下载SRP108428（阅读文献可以找到公开数据的p...

问题 LINUX系统操作这一节刚打开输入pwd时跟前方框里面不是share，是manger 为啥跟老师打开的不一样

问题 tcga_gene_exp_download.r 运行后只得到临床数据，为啥的不到基因表达的counts，tpm，fpkm

文章 GATK4进行变异检测是否可以多线程

...-nct来设定多线程运行，但是GATK4却没有类似的参数，这是为啥呢？早有研究者问过GATK的团队，官方的回答简单粗暴，没有！ 话虽如此，但GATK团队实际上还是留下了唯一的一个例外！那就是HaplotypeCaller中最消耗计算资源的模块...

问题 想请教一下，我是基于windows+docker做的宏基因组注释，然后在去宿主这一步，卡住了 不知道为啥 一直不动

问题 课程自带网页上的RStudio 打不开sh文件了？公司课程问题为啥也一定要发布才能解答呢？那花钱进的群意义是什么呢？

文章 Excel的几个小技巧

Excel已经成为大家工作学习中不可缺少的一款办公软件，在使用excel的过程中，如果掌握一些实用的小技巧，就可以让你的工作效率有质的提升。 今天，小编给大家带来几个excel常用的小技巧（以下所有操作均以excel2010为例），...

文章 群体遗传进化分析用MEGA

...获得类似下方的结果（基于K2P，和Ts +Tv）： 按照图片中指示的位置可以将结果保存为指定格式。 第三步：Phylogeny 利用这一步分析可以得到序列之间的系统发育树，这里需要选择不同的计算算法，之后要进行distance计算...

问题 提取出来的泛基因也太少了，这样对吗？泛基因编号不是说两个以上基因组才有编号吗，为啥只有一个呀

是因为只用了domain1，domain1的基因太少了吗？如果这种情况的话，分析还有意义吗？

文章 提取 VCF 文件中的基因型信息

VCF 是一种常用的生物信息学文件格式，用于存储基因组中的遗传变异数据，特别是单核苷酸多态性（SNP）和小插入/缺失（Indel）等变异。 VCF 文件通常由文本格式组成，可以用文本编辑器进行查看和编辑。每个 VCF 文件通常包含...