...pcialties：学科专业 比如，文献类型包括论著、综述、Meta分析、会议论文、letter、病例报告等；图片类型包括了 CT、普通图片、MRI、显微图片、PET、X线、统计图片等；科研领域包括基础科研、临床医学、伦理学、系统综述等；...
众所周知，xQTL 分析需要测试转录组中每个基因与一组变异的关联。通常，对于顺式 xQTL 分析，一个基因或其他的基因型数据可能有数千个变异需要测试。反式 xQTL 分析则更复杂, MatrixeQTL 为 eQTL 识别创建计算负担较小的分析。...
...胞瘤，利用WGCNA筛选关键模块中的hub基因，同时结合生存分析、ROC曲线利用其他数据库数据进行验证并筛选最终Biomarker的过程。 背景简介 多形性胶质母细胞瘤是一种非常严重的脑瘤，占所有类型的15%左右，生存时间一般少于15...
单因素方差分析的用途 方差分析用于两个及两个以上样本均数差别的显著性检验，是研究一个或多个自变量与一个连续的因变量之间的统计关系，并且测定自变量对因变量的影响和作用的一种统计方法。 方差分析最简单的形...
...定量的方法，他的计算方法有很多，常用的相对定量数据分析方法是KJ Livak（Applied Biosystems）等人在2001年提出的“比较Ct法相对定量”，即：利用ΔCt值差异来推算基因表达差异（Ct目的基因 – Ct内参基因 = ΔCt），该方法的具体...
...形式的系统进化树 树形可供选择。大家可以根据自己的分析目的来选择合适的树形。矩形进化树： 辐射状进化树： 环状进化树： 选择好树形后，如果觉得还不够美观，我们可以对树枝进行调整（我们拿环状进化树进行...
...下： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）...
...程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习...
老师，我在按照课程方法学习基因家族分析课程，用到老师教授的木薯的NBS文章中的利用hmm文件也就是对应基因家族的隐马尔科夫模型筛选得到一个蛋白序列，另外我又采取blast的方式将我要研究的这个物种和其他几个物种的该...
基于MCScanX串联重复分析结果中的tandem文件，提取属于特定基因家族内的串联重复基因对。 脚本文件名 get_tandem_gene.pl ，运行命令为： perl get_tandem_gene.pl -id hqs.id -tandem ganlan.tandem -name hqs -od ./ 命令解释： get...
例如omicsclass提供的基因家族分析，转录组分析等整套分析流程，进入run it （ID）后，不记得都有哪些软件了，不想回去看视频的话，有什么方法快速找到软件列表？ 另外，如果不是omicsclass的第三方镜像是否有类似的方法查看...
GWAS关联分析课程推荐：https://bdtcd.xetslk.com/s/2KgXQq 对于统计学假设检验来说，多重检验校正是一个非常重要的领域。我们在进行假设检验的时候，通常会设置一个零假设，之后计算出一个p值，即数据分布符合原假设的概率，p...
...息。1则表示位于玉米的1号染色体上，第二例表示注释的版本信息，第三列通常为gene，mRNA，CDS等信息，同时一个基因可能对应多个mRNA，对生物有些了解的也知道，一个mRNA即是一个转录信息， 这个和注释过后的序列文件也是一...
老师，我是去年上的您的线下培训课，我看从GEO里下载的表达矩阵里基因表达量多是有小数位的，我的那个counts值数据都是整数，如果我只想用limma包的话，老师我需要怎么处理一下呢？是log（）一下，然后用scale（） 吗？麻烦...
使用orthomcl分析同源基因时，需要用到MySQL数据库，具体操作如下： mysql -uroot -p #先用root登录create database orthomcl; #创建名为orthomcl的数据库create user 'user01' @'localhost' identified by '123.com'; #创建名为user01的用户，并设置...