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问题 课程里TCGA数据下载代码问题

请问老师TCGA头颈肿瘤在GDC网页上看有528个样本  但在按照课程的r代码怎么有546个  而且肿瘤和正常的加起来好像还少了两个 这是怎么回事 第二个问题,我按照给的代码运行,运行到这步报错了,不知道该怎么解决,希望老师...

文章 MCScanX 在biolinux上安装及使用

...加倍分析(练习) 官方网站上提供测试代码,还有测试数据,存放在MCScanX安装目录的data目录当中,非常适合初学者练习: data目录数据: 1.先来运行一下共线性分析(物种内,拟南芥为例第一个例子) 使用拟南芥的测...

问题 你好,冒昧打扰!我是小白,想向你请教mapman问题。就是自己数据ID怎么与mappingID匹配上?

自己数据ID怎么与mappingID匹配上?不会弄。

问题 求助,进入docker数据分析是设置共享文件出现问题

按照教程一步一步来的,文件名也是正常设置,是因为我的用户名是中文吗

文章 docker容器下mysql数据库还原与备份

一、数据库定时备份 1、编写mysql在docker容器中备份的shell脚本: 复制代码#!/bin/bash# zhengwei 2020-11-15#docker启动的mysql备份mysql_user="root"#数据库密码,注意自行修改mysql_password="JZTeya0!"mysql_host="192.168.1.43"mysql_port="3306"mysql_charset="utf8...

文章 linux使用ossutil下载阿里云数据

很多时候收到公司的数据是放在阿里云的,提供了Windows版的ossutil软件,但数据量很大的时候例如100G+,用windows软件下载就太慢了。 这个软件也提供了Linux版,使用它在Linux上下载阿里云数据非常方便, 一、软件下载 软件下载...

文章 HPA:人类蛋白图谱数据

...型图谱包含13种不同人体组织的单细胞RNA测序(scRNAseq)数据,以及内部生成的免疫组织化学染色组织切片,显示相应的空间蛋白表达模式。     以blood & immune cell为例      3.    PATHOLOGY ATLAS 提供了基因在肿瘤组织中的表...

文章 如何使用NCBI进行blast比对

BLAST是生命科学研究中常用的一套在蛋白质数据库或核酸数据库中进行序列相似性比对的一套分析工具。英文全称是Basic Local Alignment Search Tool。NCBI作为生命科学研究领域使用最为广泛的数据库之一,深受广大科研工作者青...

文章 使用compare_means()t.test进行显著性检验时报错

...的普遍用法 f : formula,x ~ group形式的公式,其中x是表示数据值的数值变量,group是表示相应组的具有一个或多个级别的因子。例如公式= TP53 ~ cancer_group data : formula中的数据来源 paired:是否需要执行配对检验 method:默认是wilcox...

问题 用Docker进行单细胞测序数据合并时,执行合并代码时候,报错。

老师好!用Docker进行单细胞测序数据合并时,执行合并代码时候,出现这个问题:Error in gzfile(file, "rb") : cannot open the connection Calls: MergeObject -> lapply -> FUN -> readRDS -> gzfile In addition: Warning message: In gzfile(file, "rb") :   cannot o...

问题 老师,请教您一个关于RNAseq数据分析的问题,如果我有1个对照组、3-5个实验组(每个实验组有两个重复),我可以对1-5组一起进行RNA-seq差异基因表达分析吗?可以用什么方法呢? 我目前只接触过两组间(1个对照组、1个实验组)基因表达数据的差异分析,未接触过多个实验组数据的分析,所以想请教下老师,希望得到您的帮助,先谢谢您啦!

请问多个处理组分别和对照组比对,比如处理组1和对照组比对,在命令中是怎么输入啊?老师,教程上是一个处理组一个对照组,-r指定对照组就行,但是如果还要指定对照组,怎么输入呢?谢谢!

问题 请问老师转录因子数据库,PlantTFDB为撒进不去啊,撒原因

问题 《代谢组学数据分析处理培训班》这个培训有回放么?

问题 从ENA数据库下载fastq格式,可以点击这个进行下载吗?

问题 老师,请问pheatmap做热图,要对数据取对数,在脚本里怎么加