找到约 15 条结果

文章 NCBI数据库当中下载基因组序列，cds序列，蛋白质序列等

1.打开NCBI主页：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/   数据库选择gemome,输入物种拉丁名 Homo sapiens搜索: 搜索结果如下： 包括基因组的信息，gff信息，蛋白质信息等等都可以点击下载，如果基因组组装有多个版本可点击browse list，查看多...

文章 顺式作用元件分布图绘制

...码子前1500bp），顺式作用元件种类及分布情况，具体某个数据时可以选择自己感兴趣的基因、顺式作用元件进行展示。 今天给大家介绍一款非常简单实用的在线软件GSDS：访问地址：http://gsds.cbi.pku.edu.cn；GSDS全拼是：Gene Structure ...

问题 您好，在NR数据库本地化的教程中，请问 这两个文件是在哪里下载的呢

您好，在NR数据库本地化的教程中，请问<division.dmp> <nodes.dmp>这两个文件是在哪里下载的呢

问题 老师，请教您一个关于RNAseq数据分析的问题，如果我有1个对照组、3-5个实验组（每个实验组有两个重复），我可以对1-5组一起进行RNA-seq差异基因表达分析吗？可以用什么方法呢？ 我目前只接触过两组间（1个对照组、1个实验组）基因表达数据的差异分析，未接触过多个实验组数据的分析，所以想请教下老师，希望得到您的帮助，先谢谢您啦！

请问多个处理组分别和对照组比对，比如处理组1和对照组比对，在命令中是怎么输入啊？老师，教程上是一个处理组一个对照组，-r指定对照组就行，但是如果还要指定对照组，怎么输入呢?谢谢！

文章 人类癌症数据库突变注释

cosmic70: the latest COSMIC database with somatic mutations from cancer and the frequency of occurence in each subtype of cancer. For more updated cosmic, see instructions below on how to make them.icgc21: International Cancer Genome Consortium version 21 mutations.nci60: NCI-60 human tumor cell lin...

文章 堆叠柱状图-ggplot2

绘制堆叠柱状图，重点重点在于geom_bar中postion="stack"， 数据参考：https://www.omicsclass.com/article/92 dat   type  Sample Num1     A sample1  902     B sample1  343     C sample1  564     D sample1  995     E sample1  156    ...

问题 在pfam数据库中下载hmm文件的时候用到的那个序列号是哪里找的？？？

在pfam数据库中下载hmm文件的时候用到的那个序列号是哪里找的？？？ ncbi？ 中国知网？？ 如何搜索？？？

文章 做微生物研究必懂的OTU table相关知识

...理视频帮助理解； https://v.qq.com/x/page/f0519pz5jmw.html 原始数据处理： 根据测序barcode序列区分不同的样本序列,将数据分开至不同的样品中。原始测序数据需要去除接头序列，并将双端测序序列通过序列之间的overlap拼接成单条序...

文章 NCBI 基因ID命名规则 Ensembl数据库ID命令规则

了解数据库NCBI中各种ID的命名规则可以迅速了解ID背后代表的是什么： NCBI中 前缀 意义 NM_/NP_ 已校正的mRNA/蛋白序列ID XM_/XP_ 软件预测的mRNA/蛋白序列ID NC_ 一般为染色体序列ID NG...

文章 lnd无法下载样本名称含有+的数据

linuxnd linuxnd是linux系统下载诺禾致源测序数据的软件，其基础功能如list、cp、cp -d 已经在这篇文章中给大家列出： https://www.omicsclass.com/article/2084 错误的产生 该软件在遇到样本名称中含有“+”的样本时，无法直接进行下载，...

问题 GPL7280的数据，可以读取进来，处理的过程中总是报错，请问这个cdf怎么样能解决？

GPL7280的数据，可以读取进来，处理的过程中总是报错，请问这个cdf怎么样能解决？

问题 三代全长转录组数据如何鉴定新的转录本

老师您好！请问三代全长转录组测序中，鉴定新的转录本时，是将flnc序列和参考基因组比对，还是用抛光合并之后的得到的高质量的转录本序列与基因组序列进行比对

问题 关于微生物群落功能注释-FAPROTAX数据库介绍及使用

这篇文章中的第4步进入虚拟器始终不能成功，可以教学么？

问题 F2人工群体进行GWAS分析表型数据处理？

F2代人工群体的家系记录主要用来计算亲缘关系、群体结构和PCA，但是进行关联分析的时候还是仅用个体ID后面接性状就好了是嘛？表型性状是否需要符合正态分布？

问题 有多个时期的转录组数据每个时期都有三个重复，如何进行基因注释

老师好，想问下有三个重复的转录组数据，是需要将三个重复都cat到一起吗？例如1_1.fq、2_1.fq和3_1.fq合并，1_2.fq、2_2.fq和3_2.fq合并再用hisat2比对后输入braker吗？还是直接将这六个fq文件cat到一起进行比对呀？