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文章 批量邮件推送python代码模板,可支持html邮件格式

利用python批量发送邮件,推广课程等等,可借助以下代码完成: #!/usr/bin/python# -*- coding: UTF-8 -*- import smtplibfrom email.mime.text import MIMETextfrom email.header import Headerfrom email.mime.multipart import MIMEMultipartfrom email.mime.image import MIMEImage# 第...

问题 基因组组装BUSCO多拷贝过高

物种用流式做出来是3.6G左右,用kmer估计也是3.6G左右,用HiFiasm默认参数组装也是3.6G,但是BUSCO的D数目过高,|C:99.2%[S:3.1%,D:96.1%],F:0.2%,M:0.6%,n:1614 。这是什么原因呢?后面需要怎么操作

问题 蛋白组学差异蛋白的筛选

比较两组不同数据时,每组分别设置了四生物学重复,那么比较这两组数据的差异蛋白时应该怎么把这些生物学重复的数据归一呢?还是要对其中的每一对生物学重复组分别进行比较?

文章 从月球回来的水稻种子怎么样了?

...作物、花卉种子共30余种,进行深空诱变育种实验。如今3月过去了,这批神秘种子现在怎么样了呢? 据华南农业大学消息: 该校获得共计40克的太空稻种于去年11月搭乘嫦娥五号登月,历时约23天、76万公里的“环月旅行”后,...

问题 iqtree2 iqtree2 -s supergene.phy -st DNA -m TEST -B 1000 -bnni -alrt 1000 --prefix iqtree出现报错

使用run_pipeline.pl将vcf.gz文件转换为.phy文件后运行该命令,出现报错,报错内容如下图: phy文件检查了里面有AGCTKMNRSWY这11种字符,这正常吗?是哪里出错了呢

问题 blast建库比对

...列有些是有重复的,我选择在TAIR里下载,如图所示,这基因家族有好几选项,都是基于拟南芥的,我查了文献,拟南芥里这基因家族总共是107条,那么是不是我只需要下载这107条就可以了,其他的选项里有包含转录因子...

问题 Beta多样性分析PCOA/NMDS分析无差异,Adonis检验P值小于0.05,怎么看结果?

Beta多样性分析PCOA/NMDS分析无差异,图中分不开,但是组间距离显著性分析PERMANOVA,anosim和permdisp,以及Adonis检验P值小于0.05,这样结果怎么看?

文章 提取进化树中基因的顺序

...序即可。这里我写了一脚本,如下: 用法: perl nwk_geneid.pl  -i in.nwk  -o out.txt in.nwk 为输入的nwk文件,out.txt是输出的基因ID文件。 脚本代码; use Getopt::Long;use strict;my %opts;GetOptions(\%opts,"i=s","o=s","h");open(IN,"$opts{i}") || die "open...

文章 ggplot2图片保存

R语言中可以将图片结果保存成pdf、png、tiff等等,具体涉及方法: pdf()、png()、tiff()、svg()..... 以pdf和png进行保存代码如下: 以ggplot2绘图结果 https://www.omicsclass.com/article/92   的图片保存为例 pdf(file = "p.pdf",width =12,height =...

问题 iqtree2 iqtree2 -s supergene.phy -st DNA -m TEST -B 1000 -bnni -alrt 1000 --prefix iqtree出现报错

使用run_pipeline.pl将vcf.gz文件转换为.phy文件后运行该命令,出现报错,报错内容如下图: 请问这是什么原因呢?是测序公司返给我的vcf.gz文件有问题还是我的命令有问题?

文章 sci分区,是按JCR还是中科院分区?哪更靠谱?

一说到SCI分区这话题, 学霸姐姐就想起了“热门网红”期刊——Nature Communication, 它平均影响因子10分以上、2年内总被引达302306次、各种话题不断、Nature亲儿子....... 然而,它却被划中科院划到了2区。 到底分区的高低是...

问题 芯片探针解读

各位老师,我有问题关于芯片探针的。就我有一芯片同时测得是mRNA和lncRNA。然后,根据平台文件的Gene sybmol进行注释,但是有很多Gene sybmol是这样子的XLOC_l2_007835,XLOC_l2_015212这些是什么东西?也不知道它是不是基因,可不可...

问题 具体用那些数据分析 是两两比较还是总的比较

你好 老师 我做了5时期的种子的转录组,其中有两两比较,具体怎么分析,请老师知道一下

问题 分析差异基因时,为什么要用FDR,能直接用p_value吗?

问题 老师您好,做GWAS分析使用GLM模型时,p值为什么都是-0啊?