找到约 15 条结果

文章 OTU互作网络分析用MENA

...上传和分析的网络结果。 上传数据 点击主页左侧Upload your dataset选项后,选择对应的文件并且对数据进行命名后提交,提交过程中注意网站对文件的要求,包括文件大小,格式等等(下图)。提交成功后会自动显示上传数据的...

问题 tcga生存分析

...了, Error in time[[i]] <- sort(unique(y[who, 1])) :    attempt to select less than one element in integerOneIndex 我导入的exprSet是, exprSet <- read.table("E:/TCGA/mirna-log2-2.txt",header = T,sep="\t",na ="NA") 不知道该怎么解决,问题是我还成功绘制过一张...

文章 盘点:科研学术圈不为人知的行业“黑话”

...教师中压力最大的群体。 独立PI:独立的 Principle Investigator,能够拥有课题组话事权的导师,通常指代青椒在高校担任教职后能够从事独立工作。 H因子:也称H-index,高被引因子,计算方法复杂建议谷歌,H因子越高这个人越牛...

问题 老师,请问CGVIEW中的gene.blast文件格式

...blast文件如下: Cannot parse the #PROGRAM field in the BLAST results file ./YC_bacteria_cgview/blast.txt at ./scripts/cgview_xml_builder/cgview_xml_builder.pl line 4716, <INFILE> line 0.000000. #PROGRAMquery_id    match_id    match_description    %_identity    alignment_le...

问题 老师我想请问一下有关基因家族成员鉴定出来命名的问题,麻烦老师指导一下

...问题,有文献上会说we named these identified genes according to their homologous genes in Arabidopsis 这句话意思是命名是根据自己研究的物种中的A基因家族成员与拟南芥中的A基因家族成员的同源性命名的吗?意思是与拟南芥中的A1同...

文章 群体基因交流分析的几个统计值

...考资料: f4:https://reich.hms.harvard.edu/sites/reich.hms.harvard.edu/files/inline-files/preprints202003.0237.v2.pdf fb:https://www.nature.com/articles/s41559-018-0717-x Dsuite:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/1755-0998.13265

问题 重测序

...data_qc.sh.o& , 现在显示的错误是cat: /data/data.txt: No such file or directory 但是我把这个命令粘贴到屏幕上就可以运行,在sh里面怎么说找不到文件那。命令如下 for i in $(cat $workdir/data/data.txt); do echo "RUN CMD: fastp --thread 50 --qualified_qua...

文章 跟着文献学做图 | 用蛋白质序列做主成分分析(PCA)

...t.mase数据集: > library(seqinr)> mase.res <- read.alignment(file=system.file("sequences/test.mase",                                              package="seqinr"), format = "mase") 查看mase.res数据集的格式,若不理解可使用?as.alignment查看该...

问题 circos 字体大小与比例问题

...=0.75         color=set2-8-qual-1         crest=0.5         file=/Users/823371123/Desktop/work/SBT/棉花基因家族分析/共线性分析/ghgrga/quan/SBTLickedRegion.tab.txt         radius=0.88r         #<rules>             #<rule>               ...

问题 泛基因组核心基因和可变基因长度比较core_pan_gene_compare.r报错

...tmp*, value = contr.funs[1 + isOF[nn]]) : contrasts can be applied only to factors with 2 or more levels Calls: aov ... model.matrix.terms -> model.matrix.default -> contrasts<- Execution halted。我在泛基因组分类的时候只分为了3类,core, dispensable和private。是这个...

问题 做psmc的时候,显示没有这个get_fa_by_id.pl

...pts/get_fa_by_id.pl: /biosoft/miniconda/bin/perl: bad interpreter: No such file or directory

问题 基因家族分析文章:筛选时为什么选用基因组数据库的编码蛋白,而不是蛋白组数据库?

...,我基因家族分析的文章被审稿人问道:It is not clear to me why authors search protein from the genome, not proteome. Moreover, the authors should underline that their results report the finding of candidate genes encoding protein and not candidate p...

文章 evolview 3.0最新更新美化进化树

... trees from user guide tree examples)Select tree input format.Tree text editor: Paste the tree contents here. or use demo tree option to load trees from user guide examples.2. 基础设置: 上传完成之后,可以点edit,做一些进化树的基础设置,和2.0差不多: 3 高级...

问题 扩增子OTU分析报错

...VA_132_QIIME_release/rep_set/rep_set_16S_only/97/silva_132_97_16S.fna --id_to_taxonomy_fp /work/database/SILVA_132_QIIME_release/taxonomy/16S_only/97/taxonomy_7_levels.txt --assignment_method uclust --similarity 0.8 Command returned exit status: 1 Stdout: 用的ampliseq-q1:v1.2的版本,程...

问题 您好,想请教一下 linux中 R语言安装magick的包装不上的问题

...错:Error: package or namespace load failed for ‘magick’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...):  无法载入共享目标对象‘/usr/local/lib64/R/library/00LOCK-magick/00new/magick/libs/magick.so’::   /usr/local/lib64/R/library/00LOCK-magick/00new/magick/libs/magick.so: undefine...