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文章 quota 显示的space 与du显示的不一致,导致文件上传失败

... 参考:https://unix.stackexchange.com/questions/156897/why-does-du-and-quota-results-not-match

文章 picrust1 16S 微生物功能预测

...tion -o predictions_kegg.txt #COG功能预测 predict_metagenomes.py --type_of_prediction cog -i normalized_otus.biom -o predictions_cog.biom -c $dbdir/picrust_data/cog_13_5_precalculated.tab.gz biom convert -i predictions_cog.biom --to-tsv --header-key COG_Description -o predictions_cog.txt ...

问题 docker 启动报错&容器中进程终止

...,均报下列错: ERRO[0000] invalid internal status, try resetting the pause process with "/usr/bin/podman system migrate": could not find any running process: no such process  以及前期在docker中进行进化树构建时,进程经常自动中止(docker 创建时指定了最大使用...

文章 Python中的Tkinter库报错

...形界面,否则会报如下的错误_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable 一个可能的解决方案是在matplotlib中使用"Agg"后端,它可以在没有显示设备的情况下生成图形 import matplotlibmatplotlib.use('Agg') 当然,很多时候...

文章 多款软件进行vcf合并--gatk、vcftools、bcftools

...=<ID=q10,Description="Quality below 10"> ##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read Depth"> ##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality"> ##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype"> ##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,D...

问题 老师!求解答!在TCGA数据基因ID转换中出错!!

...ed early on line 266653. Expected 9 fields but found 1. Consider fill=TRUE and comment.char=. First discarded non-empty line: <<##sequence-region chr2 1 242193529>>

问题 第一步文件导入qiime2一直出错,按照视频设置好

There was a problem importing /work/my_amplicon/A/manifest.ckd.txt:   /work/my_amplicon/A/manifest.ckd.txt is not a(n) PairedEndFastqManifestPhred33V2 file:   Filepath on line 1 and column "forward-absolute-filepath" could not be found ($datadir/SRR7441413_1.fastq) for sample "SRR7441413".

文章 基因家族分析课程更新-批量进行kaks计算

...ed nucleotide alignments guided by amino acid alignments are more reliable and accurate than direct nucleotide alignments)。该方法尤其对于序列差异较大的基因对,比对更准确,可以避免由于比对问题导致KaKs_Calculator计算不出结果。 下载安装和数据准备 ...

文章 OTUtable标准化方法

...ble.txt -o  normalized_otu_css/CSS_normalized_otu_table_hdf5.biom --table-type="OTU table" --to-hdf5  --process-obs-metadata taxonomybiom summarize-table -i normalized_otu_css/CSS_normalized_otu_table_hdf5.biom -o normalized_otu_css/CSS_normalized_otu_table_summary.txt#对OTU丰度进行标准化 ...

问题 tgsgapcloser报错

... correction by racon with tgs reads.               -   TGS reads type is ont . MINIMAP2_PARAM is  -x ava-ont   MIN_IDY is 0.3 . MIN_MATCH is 2000 . INFO  :   Checking basic args & env end. INFO  :   Step 1 , run TGSSeqSplit to split scaffolds into scaftigs(contigs).  ...

文章 阿里云短信发送API笔记

...dkcore.profile import region_providerfrom aliyunsdkcore.http import method_type as MTfrom aliyunsdkcore.http import format_type as FTimport constimport os, argparse, glob, os.path,time,re"""短信业务调用接口示例,版本号:v20170525Created on 2017-06-12"""try:    reload(sys)    sys.s...

问题 泛基因家族鉴定-找不到Bio::SeqIO模块

Can't locate Bio/SeqIO.pm in @INC (you may need to install the Bio::SeqIO module) (@INC contains: /usr/local/lib64/perl5/5.32 /usr/local/share/perl5/5.32 /usr/lib64/perl5/vendor_perl /usr/share/perl5/vendor_perl /usr/lib64/perl5 /usr/share/perl5) at /home/us170/scripts/ParaAT.pl line 7. 该怎么...

文章 ggplot2-气泡图(控制点的大小范围)

...   2.397575 1.772599e-03   128  ko00860        Porphyrin and chlorophyll metabolism    2.574238 1.772599e-03   149  ko00062                       Fatty acid elongation    2.857551 2.316650e-03   1810 ko00630     Glyoxylate and di...

文章 文献图片检索工具-Openi,用图片检索文献!

...关,这些图还可以根据下图红框内选项进行筛选:Article Type:文献类型;Image Type:图片类型;Subsets:科研领域;Collections:数据库来源;Spcialties:学科专业 比如,文献类型包括论著、综述、Meta分析、会议论文、letter、病例报...

问题 老师您好,我是刚接触生物网络分析的小白,在我做otu table 共存网络分析时出现下面这种情况:

...0.001) 在这最后一步总是出现报错: Error in rcorr(t(matrix), type = "spearman") : must have >1 column 别人用相同的代码都可以正常运行,但是我却不行,我猜想可能是数据格式的问题,但是修改了很多遍依然没能解决这个问题,希望老师...