找到约 15 条结果

文章 pheatmap绘制热图详解

...s——Implementation of heatmaps that offers more control over dimensions and appearance. 热图是对实验数据（尤其是基因的表达量）分布情况进行分析的直观可视化方法，可以用来进行实验数据的质量控制和差异数据的具像化展示，还可以对数据...

文章 immune_bar_plot.r 免疫侵润分析bar绘图

...otoptional arguments:  -h, --help            show this help message and exit  -i filepath, --input filepath                        input the immune martix [required]  -t title, --title title                        input legend tittle name [default cell type]  -a xla...

问题 鲁棒性检验代码

...据是cel我该怎么办 > library(rbsurv)>  setwd("C:/Users/Administrator/Desktop")>  Mydata<-read.table(file = "C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\gliomaSet.txt",header=TRUE)> head(Mydata)[0:6,0:6]           g1      g2      g3      g4      g5   ...

问题 转录组上游分析之定量比对Hisat2出现内部异常错误

...; file cannot also be specified.  Please run HISAT2 separately for mates and singles. Error: Encountered internal HISAT2 exception (#1) Command: /home/vip6/miniconda3/envs/rna/bin/hisat2-align-s --wrapper basic-0 -p 3 -S /home/vip6/project/human-64-Asthma-Trans/Mapping/Hisat//SRR1039508.Hisat_al...

问题 在用gemma分析gwas时，调用perl脚本中的sort_trait.pl，发生报错，请老师帮忙解答，谢谢老师。

perl $scriptdir/sort_trait.pl snp_var.fam \$workdir/05.trait/Thousand_Grain_Weight_2020.txt  |cut -d " " -f 1-5,7 >snp_var.fam1 mv -f snp_var.fam1 snp_var.fam readline() on closed filehandle IN at /home/sdl/trial/5.23gwas/scripts/sort_trait.pl line 11.

文章 使用Copilot自动在Rstudio中写代码

...bal Options 下面就有 Copilot，再 ✔Enable Github Copilot--->Sign in 注意：这里需要有 github 账号，如果没有可以先注册 github 账号 之后会弹出网址，点进网址，再填验证码 打开github 填验证码，验证码在网址下面，填好后continue ...

文章 采用traceback 进行R语言报错信息的调试

...pr = rnaExpr, + mir.expr = mirExpr) Error in attributes(.Data) <- c(attributes(.Data), attrib) : 'names' attribute [11055] must be the same length as the vector [2777] > traceback() 5: structure(res, levels = lv, names = nm, class = "factor") 4: unlist(pc.ta...

文章 病毒衍生的small RNAs： 宿主与病毒互作的分子“证据”

...体可以被宿主的不同抗病毒途径RNA decay、RNA interference、 and RNase L pathways识别并降解，从而产生大量的病毒衍生小RNA（Virus-derived small RNAs）。这些小RNA具有反映其来源的分子特征。首先，可以使用小RNA来组装病毒序列并识别它们...

文章 linux设置磁盘自动挂载

...maintained under '/dev/disk' # See man pages fstab(5), findfs(8), mount(8) and/or blkid(8) for more info # /dev/mapper/centos-root / xfs defaults 0 0 UUID=f12446c3-9101-4256-b900-6b0963a0b0e0 /boot xfs defaults 0 0 #/dev/mapper/centos-swa...

文章 vscode更新导致低版本系统无法登陆的问题

...ven for MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. Written by Roland McGrath and Ulrich Drepper. 版本够,如果不够你就下载一下新版的然后放到自己的环境变量里 ╰─[~ ❤ ▶ strings /usr/lib64/libstdc++.so.6 | grep GLIBCXX # 看一下 libstdc++版本 GLIBCXX...

文章 TCGA 数据的多组学WGCNA联合分析

...分析，比如lncRNA, mRNA， miRNA 等，而文章《identifying mirna and gene modules of colon cancer associated with pathological stage by weighted gene co-expression network analysis》则结合Gene,miRNA 分别进行WGCNA的分析，获得性状相关的Hub Gene和 Hub miRNA, 再基于miRNA...

文章 基因组注释流程，PASA mysql 数据库启动 exited

...og： $ docker logs 49b994b23f23 2023-03-21 09:38:40+00:00 [Note] [Entrypoint]: Entrypoint script for MySQL Server 5.7.41-1.el7 started.2023-03-21 09:38:40+00:00 [ERROR] [Entrypoint]: mysqld failed while attempting to check configcommand was: mysqld --verbose --help --log-bin-index=/tmp/tmp.ogWM7Tz...

文章 vim显示行号、跳转到指定行或列

...用于跳转到当前行某一列的一个命令 (To screen column [count] in the current line)，| 表示当前行的第0列 (行首) (2)正常模式下输入命令 $ 跳转光标到当前行的行尾； (3)正常模式下输入vim命令 0nl 或 n| 跳转到当前行的第 n 列。 表示...

文章 2022年基因家族第1篇—大型动物基因家族分析怎么写？！

...Bos Indicus (19), Bos grunniens (19), Bos mutus (19), Bubalus bubalis (19) and Bison bison bison (18)，不同牛基因组中Wnt家族数量稍有差异。下图为s Bos taurus中Wnt家族基因详细信息。 2. Wnt蛋白家族基因进化及结构分析 作者用19个牛Wnt家族基因保守...

文章 meme安装报错

                 from xsltutils.c:33:/usr/include/libxml2/libxml/tree.h:1124:3: note: expected ‘xmlBufferPtr’ but argument is of type ‘xmlBufPtr’   xmlBufferWriteQuotedString(xmlBufferPtr buf,   ^xsltutils.c: In function ‘xsltSaveResultToString’:xsltutils.c...