...同源物种cegma的比例,判断保守基因组装情况。 BUSCO也是这个原理,通过与已有单拷贝直系同源数据库的比较,得到有多少比例的数据库能够有比对,比例越高代表基因组完整度越好。
... 然后就被吸到宝葫芦里去了,金角大王成功拿到一血。 这个桥段相信大家已经看过无数遍了。 有一次我在讲课讲到某工具时,不知怎的就想起了它,于是现场做了个测试: 我把手里的话筒比作宝葫芦,找前排的某帅哥问: ...
...这份排行榜中,前十四名里,腾讯的产品就占了七款。 这个耀眼的数据足以说明,腾讯的产品是有多受欢迎。 腾讯的产品为什么会那么好呢?其实这和腾讯的创始人马化腾以及其企业文化有关。马化腾是一个天文学爱好者,爱...
...管理协会给质量的定义是“满足需求,符合适用性”。从这个定义来看,质量就是能够明确定义和满足用户及利益相关者的要求,而这也正是恰恰很难衡量和控制的。 比如操作大型项目的人都有感触,一个项目方案考虑的再...
... 在ceRNA的概念中有两个关键词,竞争和内源,内源指的是这个调控机制本来在生物体内就存在,而竞争就是这个调控机制的核心。 比如:miRNA可通过抑制目的基因mRNA的翻译,或促进mRNA降解来起到负调控的作用;circRNA,能够像...
...站打不开可看这里:https://www.omicsclass.com/article/1308 打开这个工具,它的界面如下: 1、输入数据类型 绘图的输入文件有四种类型的数据可选: BED :大家可以在基因组GFF文件筛选基因的这些信息,第一列是基因ID,第二列是...
...们的扩增子流程中的qiime2做了更新,更新到了最新的2022.8这个版本。另外,我们也对qiime2的物种注释分类数据库进行了同步更新以避免数据库与scikit-learn版本不一致时的报错,因此,老版本的qiime2分类数据库和新版的qiime2分类数...
...组数据,影像,Excel等,上述两个库不能存放的,上传到这个库。 生物工具库(Biocode):存放代码,部分替代github。 基因组序列数据库(GWH):类似于NCBI 的genebank, 基因组拼接组装完的数据可以上传到这里。 基因组变异库(GVM...
...他们构建一棵系统发生树。这样就可以从树上推测出谁和这个新细菌的关系最近。系统发生树还可以预测一个新发现的基因或蛋白质的功能。系统发生树还分为有根树和无根树(下图),顾名思义,有根树就是有根,无根树就是...
...老面孔,近年来circRNAs可谓是风生水起,大家一起来看看这个circRNAs到底是何方神圣吧?说不定可以成为您科研工作的有力武器! 1 环状RNA是什么? circRNAs(Circular RNAs,环形RNA分子)是一类不具有5' 末端帽子和3' 末端poly(A)尾巴...
...要打很多字,有点麻烦,lrzsz十多年没跟新了,所以我推荐了这个软件trzsz用法和lrzsz差不多,也有额外的功能,有需要自己看帮助有很多版本,常见的是python和go 的,go的版本支持隧道,速度比scp还快,尤其是传很多小目录的情况 go版本有需...
... 神奇的投稿效应:周二命中率最高,周末被拒率最高! 这个结论可不是学霸姐姐胡说的,有论文为证: 这篇论文是2016年4月发表在Physica A: Statistical Mechanics and its Applications上。 (学霸姐姐内心os:看到没,又是4月,请叫我神...
...吧 一般而言有两种常见方法 1 SRA Run Selector直接获取,这个页面链接如下,https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study/操作也简单,直接搜索project ID号,就可以了 然后选择自己想要的直接下载就行 得到的文件直接传给prefetch,类似 pref...
...题了,怎么也算不出来,要是layout文件有问题,那么下面这个微共线性分析就不会运算出来,直线我也尝试了,没问题可以运行出来,就是到了arrow和着色就不行了,想问一下,在咱们的docker里面是不是路径有问题,或者python的...