老师您好，我目前正在学习《基因家族分析》课程 在预测顺式作用元件这一步： 下载了野蔷薇（Rosa multiflora）的基因组注释gff3文件RMU_r2.0.braker1.gff3， 前期鉴定出的蛋白ID（即基因）ID的txt文件RmPMTID_gene.txt， get_gene_weizhi.pl脚...
...达数据的时候，Rstudio代码如下： （Ubuntu 环境 Rstudio-server版本 ） library(TCGAbiolinks) query <-GDCquery(project = "TCGA-COAD", data.category = "Transcriptome Profiling", data.type = "Gene Expression Quantification", ...
...程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学...
方差分析(Analysis of Variance，简称ANOVA)，又称“变异数分析”，是R.A.Fisher发明的，用于两个及两个以上样本均数差别的显著性检验。 由于各种因素的影响，研究所得的数据呈现波动状。 造成波动的原因可分成两类，一是不可控的...
MutMap分析原理： mutmap分析原理如下图： MutMap适合对EMS诱变的隐性突变基因进行分析。通过EMS诱变和自交得到纯合体后，将突变体和其亲本回交得到F1，F1自交得到的F2后代会出现表型的分离，得到野生型表型群体和突变体表...
limma包进行双通道芯片分析过程，基于原始数据可以通过校正标准化获得对象MAList，其中存放了M值和A值，可以利用exprs.MA将MAList转换成红绿荧光强度值（已经对数转化log2），每个芯片都将有两列数据，一列对应R(红）一列对应G(...
...载、安装JDK 首先需要获得JDK，登录oracle官网，选择最新版本进行下载，其链接如下：http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/jdk9-downloads-3848520.html 点选 "Accept License Agreement" ，选择Windows 64位的版本进行下载。 然后双击下载...
...，不会挖掘的数据，没有思路的文章，沟通不畅的个性化分析，求人不如求己，一切痛点都能解决：1. 单细胞/空间转录组正在大火，高分文章必备，0基础学单细胞/空间转录组分析，做更牛的个性化分析，绘更漂亮的图，点这个...
老师好，我有个问题，不同物种之间同源蛋白序列进行多序列比对时，是用保守结构域进行比对比较好，还是用全部序列比较好？因为很多序列是从NCBI上下的，不能保证其序列的完整性。而且出来的比对图非常长，不好往文章...
小编经常遇到这样的一些个性化分析，例如，下载某物种某染色体XXXX-XXXX碱基区域内的全部基因信息，尤其是BSA、QTL定位、GWAS等项目客户，该类需求是很多的；之前给大家分享过一个利用Ensembl数据库网站提供的biomart工具进行基...
我在学习转录组数据自主分析，在第11课实验质量评估，采用RSeQC 对bam 文件进行质控分析时，用inner_distance.py报错。 报错信息： manager@bl8vbox[QC] inner_distance.py -i /home/manager/rnaseq/work/3.alignments/hisat2/UHR.bam -r stringtie_merged.bed -o ...
...构+motif—1张图全显示| 基因组间共线性图 | 多方法、多版本的微生物网络图绘制课程 | 热图竟然还能用Excel来画 | Cytoscape-网络图绘图技巧 | 怎么做一张好看的分类学树状图 |
请问这三个元件是不是都是ABRE元件啊，还是三种不一样的元件
...可能一个Fragments的2条Reads最后只有一条进入最后的表达量分析。总之，对某一对Reads而言，这2条Reads只能算一个Fragments，所以，Fragment的最终数目是Reads的1到2倍之间。 感觉我对这句话的理解应该 reads 的数目应该是Fragement的1-2倍...