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文章 shebang介绍及用法

...的,而不是读就可以了,因此需要手动设置权限 chmod 755 file_name 然后你就可以直接使用该文件了,如 如果是常用的还可以链接到你你环境里有的路径,那就不需要路径了,直接输入文件名就能启动 除了直接设置结对路径...

文章 关于Cytoscape利用蛋白质互作网络分析info文件绘制网络图过程中节点String_id转换成GeneID 或者Symbol问题

...过程中,将整理后的deg_mapped对应的文件,作为Table导入,File——Import——Table——File,设定识别节点为String_id。之后在控制面板,Style下,修改节点Node的label显示,设置显示为输入table的Gene或者Symbol列即可让图片上节点显示的标...

问题 基因组注释:10.PASA_update,根据fa和gff文件生成pep或者cdna

基因组注释:10.PASA_update,根据fa和gff文件生成pep或者cdna文件,一直显示: No such file or directory at /share/work/biosofTransDecoder/TransDecoder-v5.5.0/util/../PerlLib/GFF3_utils2.pm line 37, <$filehandle> line 112.

文章 什么是MD5

...该软件后,对下载回来的文件用专门的软件(如Windows MD5 Check等)做一次MD5校验,以确保我们获得的文件与该站点提供的文件为同一文件。 具体来说文件的MD5值就像是这个文件的“数字指纹”。每个文件的MD5值是不同的,如果...

文章 Python中运行时出现SyntaxError报错

...在Python中运行时出现 SyntaxError: Non-ASCII character ‘\xe9’ in file 异常……   经过查询找到原因:Python的默认编码文件是用的ASCII码,你将文件存成了UTF-8也没用。 解决办法很简单: 只要在文件开头加入 # -- coding: UTF-8 -- 或者 #codi...

文章 eQTplot包绘图报错解决:“Caused by error in `db_collect()`”

...装的dbplyrremove.packages("dbplyr")#重新安装指定版本的dbplyrdevtools::install_version("dbplyr", version = "2.3.4") 问题解决:) https://stackoverflow.com/questions/77370659/error-failed-to-collect-lazy-table-caused-by-error-in-db-collect-using

问题 老师们好,在生成gvcf文件合并vcf文件时,出现这种警告信息,请问是什么原因,如何处理啊?

... at Chromosome hic_scaffold_1 position 9583478 (TileDB column 9583477) has too many genotypes in the combined VCF record : 1081 : current limit : 1024 (num_alleles, ploidy) = (46, 2). Fields, such as  PL, with length equal to the number of genotypes will NOT be added for this sample for this locati...

文章 perl的内置函数scalar

...度,但是,在scalar的说明里面并没有这一项。 Forces EXPR to be interpreted in scalar context and returns the  value of EXPR. 中文含义:强制表达式EXPR在标量上下文进行解释。 假如,我定义了一个数组@arr=("one","two","three"),该数组在标量环境...

文章 TCGA癌症数据库挖掘发表的大文章CNS级别汇总2019

...inal marker publications by cancer type. Supplemental and associated data files are located in the GDC.2008Comprehensive genomic characterization defines human glioblastoma genes and core pathwaysExit DisclaimerNature. 2008;455(7216):1061-1068. doi:10.1038/nature07385 2011Integrated genomic analys...

问题 tcga生存分析

...了, Error in time[[i]] <- sort(unique(y[who, 1])) :    attempt to select less than one element in integerOneIndex 我导入的exprSet是, exprSet <- read.table("E:/TCGA/mirna-log2-2.txt",header = T,sep="\t",na ="NA") 不知道该怎么解决,问题是我还成功绘制过一张...

问题 老师,请问CGVIEW中的gene.blast文件格式

...blast文件如下: Cannot parse the #PROGRAM field in the BLAST results file ./YC_bacteria_cgview/blast.txt at ./scripts/cgview_xml_builder/cgview_xml_builder.pl line 4716, <INFILE> line 0.000000. #PROGRAMquery_id    match_id    match_description    %_identity    alignment_le...

文章 盘点:科研学术圈不为人知的行业“黑话”

...教师中压力最大的群体。 独立PI:独立的 Principle Investigator,能够拥有课题组话事权的导师,通常指代青椒在高校担任教职后能够从事独立工作。 H因子:也称H-index,高被引因子,计算方法复杂建议谷歌,H因子越高这个人越牛...

问题 老师我想请问一下有关基因家族成员鉴定出来命名的问题,麻烦老师指导一下

...问题,有文献上会说we named these identified genes according to their homologous genes in Arabidopsis 这句话意思是命名是根据自己研究的物种中的A基因家族成员与拟南芥中的A基因家族成员的同源性命名的吗?意思是与拟南芥中的A1同...

问题 重测序

...data_qc.sh.o& , 现在显示的错误是cat: /data/data.txt: No such file or directory 但是我把这个命令粘贴到屏幕上就可以运行,在sh里面怎么说找不到文件那。命令如下 for i in $(cat $workdir/data/data.txt); do echo "RUN CMD: fastp --thread 50 --qualified_qua...

文章 OTU互作网络分析用MENA

...上传和分析的网络结果。 上传数据 点击主页左侧Upload your dataset选项后,选择对应的文件并且对数据进行命名后提交,提交过程中注意网站对文件的要求,包括文件大小,格式等等(下图)。提交成功后会自动显示上传数据的...