问题 差异基因用p-vaule筛选可以吗？

老师，您好：转录组分析时因为DEGs个数较少，用的p-vaule筛选的DEGs,审稿人一直问为什么不用FDR，老师这个问题该怎么回答。 Point 6: - Line 600: DEGs were determined using p-value < 0.05 and fold change ≥ 1.5. What is the rationale behind using pvalues i...

问题 老师，请教一下，用gatk call g.vcf.gz格式的文件是，运行中断了，请问怎么样才能和之前跑的数据接着跑，而不是从零开始呢

问题 转录组测序数据量如何选择？

我想做个转录组实验，但是不知道应该测多少合适，公司说有有4G、6G、8G之类的是啥意思？怎么衡量测的数据量够不够呢？

文章 2019年国自然结果分析，生命科学领域难度又又又增加了吗？

...么增长了这么多，你还是没中呢? 怪只怪大家研究都做得更好了，参与度更高了， 这一点从往年递交份数的显著提升和中标率的总体下降就能感受到(青年项目从17.03 % 降至 15.19 %，面上项目从 19.40 % 降至 17.68 %)。 另外，年龄因...

问题 做完蛋白组后，验证如何做呢？

挑选几个蛋白进行验证呢？挑选的标准是什么呢？都有什么方法呢？

问题 hgmd,omim,lovd数据库

老师 能分享一下最新的这几个数据库的下载数据吗，多谢多谢

文章 cactus-bin-v2.9.9 安装笔记

....md # Installation of the Cactus binary distributionThis describes the steps require to install the Cactuspre-compile binary, static linked distribution.## ExtractingIf you have not already extract the distribution and cd into the cactus directory:```tar -xzf cactus-bin-v2.9.9.tar.gzcd cactus-bin-v...

问题 《微生物宏基因组分析实操》课程，配制分析环境（doc.sh）遇到Bug

...io/omicsclass/metagenomics:v1.0” 我在doc.sh文件代码中输入第一个镜像，可以启动docker pull进行镜像下载，但是4个小时后仍然报错“Error: writing blob: storing blob to file "/var/tmp/storage1966479595/2": happened during read: unexpected EOF[us078@omicsclass  01:28...

问题 《微生物宏基因组分析实操》课程，配制分析环境（doc.sh）遇到Bug

...micsclass/metagenomics:v1.0” 我在doc.sh文件代码中输入第一个镜像，可以启动docker pull进行镜像下载，但是4个小时后仍然报错“Error: writing blob: storing blob to file "/var/tmp/storage1966479595/2": happened during read: unexpected EOF[us078@omicsclass  01:...

问题 泛基因家族成员鉴定

老师，在泛基因家族分析中，家族成员鉴定部分，得到了112个基因型的所有成员，并经NCBI等网站验证结构域后得到了可靠成员列表直接相加就可以吗，不需要去冗余吗?cat *.WRKYgene.list &gt; maize.WRKYgene.list

文章 cBioPortal数据库使用教程

...向新的生物学视野，治疗和临床特征的转变。 cBioPortal这个网站，促进多维度癌症基因集数据的探索，可以允许跨基因，样本和数据类型的可视化分析。用户可以可视化一个癌症研究中多样本间基因改变的模式，并比较点多癌症...

文章 细胞凋亡检测最火方法——Annexin V/PI双染法

...证优异的实验结果; 6、专业的售前售后技术支持，可以更好完成凋亡实验。 Annexin V系列凋亡检测产品目录 Ø Annexin V荧光双染凋亡试剂盒 Ø Annexin V凋亡检测单品 Ø Annexin V蛋白 实验数据：Annexin V-FITC/PI检测试剂盒分群效...

文章 ifconfig不显示ip

...                      TYPE      DEVICE  eno1  1377a295-708b-4cb4-a1cb-04d8d58cc2bc  ethernet  eno1    lo    e9513de2-7f3b-4faa-a7c0-c8544e0bdcfa  loopback  lo      eno2  fe51385f-86b2-470d-a846-27c73ac4eff1  ethernet  --      eno3  f9129c6b-ca95-4d81-b165-13254c...

文章 ggplot2点图geom_point中点的shape有多少？

ggplot2可以利用geom_point绘制散点图，而点的形状控制参数shape会显示多少效果呢？(注意此处只介绍shape的设定，不是aes(shape)映射） 可以通过查询?shape 获得以下内容： # Shape examples # Shape takes four types of values: an integer in [0, 25], #...

问题 关于差异基因表达的问题

我的数据是种子在授粉后四个不同天数的转录组数据，经过分析得到了count值和fpkm值，请问我可不可以把其中一组数据作为对照，然后用其他三组数据去做差异表达分析