问题 您好，我在检索完一个2.3G大小的基因组文件后，得到.misa 和.statistics为后缀两个文件，在用调用primer 3.0批量设计引物时，这块看不懂，您能叫我一下吗

问题 求教老师，我在做大麦基因家族分析构建进化树时，拟南芥中的已知的成员和我大麦中鉴定出的成员分不到一起，拟南芥单独分了一支，没办法做比较，这种情况怎么解决呀

因为这个家族只在拟南芥里鉴定过，只有18个成员，我做的亚族只有4个成员。现在拟南芥和大麦构建进化树的结果没法做比较

问题 mcscan/AT.blast文件的生成

老师：        我在做基因加倍与复制blast all时，运行约7个小时后，没有生成mcscan/AT.blast文件，这是怎么回事呢？

问题 提取结构域序列

...，您好，关于根据...hmm_out结果文件提取结构域序列，这个文件可能是一个基因的几个转录本都在，所以提取结构域序列的时候是不是会提取到一个基因不同转录本的结构域序列都提取出来了啊，实际上我们只需要一个基因的一...

文章 甲基化水平如何计算

...的计算通常基于测序数据，例如全基因组甲基化测序（WGBS）数据。这种数据提供了每个碱基位点的甲基化状态。甲基化水平一般定义为某个特定位点或区域内甲基化的碱基数占总覆盖碱基数的比例。以下是计算甲基化水平的具...

问题 基因家族分析问题

...基因名称不同，但其位置信息完全相同（比如下图中的3个不同基因的在基因组中的位置信息完全相同），请问这种现象正常吗？还是基因组注释的有问题？在数据分析时，应该处理这些基因呢？需要删除其中的基因吗？

问题 群体sv分析

用三代数据sv结果对二代数据进行基因分型，合并两个结果时出现问题，bcftools merge合并的结果，缺失率太大，导致用plink进行pca分析时因缺失率太高无法进行，survivor merge 1000 1 1 0 0 50，合并后样本名减少，并且计算Fst为几个固定...

问题 全转录组到底能不能测到circRNA？

今天问了个测序公司销售，说是全转录组能够测到mRNA，LncRNA，circRNA，确实如此吗？

文章 shell脚本中解决SCP命令需要输入密码的问题

...钥文件。   这里假设主机A（192.168.100.3）用来获到主机B（192.168.100.4）的文件。 在主机A上执行如下命令来生成配对密钥：ssh-keygen -t rsa 遇到提示回车默认即可，公钥被存到用户目录下.ssh目录，比如root存放在： /root/.ssh/id_rsa....

问题 扩增子分析结果的差异显著性的p值在哪里找到

在输出结果文件夹里好像没有找到

问题 比较基因组共线性分析

老师，我做拟南芥和苜蓿之间我的基因的协同性分析，拟南芥中有3个，苜蓿中有七个，协同性分析结果只有一条基因配上了， 水稻里面也是三个，一个都没配上，请问正常吗？

文章 一分钟让你学会PDCA循环项目管理模式

某家婴儿车公司的CEO接到了一个严重的产品质量问题投诉，句句在理，针针见血。CEO非常重视，紧急召开高阶主管会议，研究对策。讨论几小时后，各部门都有不少改进的提议，执行长也提出很多要求。最后执行长说：「不看广...

文章 singularity使用基础

singularity使用 1. singularity简介 singularity与docker功能相似，但是相比与docker需要root权限，或者专门添加用户组，singularity在非root时也可使用，且轻量级，修改方便。singularity镜像有两种格式：sif格式可用于部署；sanbox格式是可写...

问题 基因家族鉴定完后，如何做基因表达？

基因家族有80个成员，对材料有两种处理分时间取样，基因表达该采取哪种办法合适？转录组？基因芯片？还是自己荧光定量PCR呢？

问题 metastat的结果文件为什么p值都很大，包括示例文件的