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文章 TCGA样品来源机构汇总 Tissue source site(TSS)

...管腺癌预后关键基因TCGA数据库挖掘-肾细胞癌相关biomiarker筛选案例解析文献精读-TCGA数据挖掘生物信息文章(肺鳞癌)文献精读-GEO数据挖掘生物信息文章(宫颈癌)GEO数据挖掘直肠KM-plotter在线做生存分析GEO数据如何挖掘?案例...

文章 碰到奇葩审稿人怎么办?这位作者靠怒怼审稿人登上SCI期刊!

...被审稿人一而再、再而三地要求修改, 甚至修改到最后经完全不是之前了版本了, 你还能和颜悦色地接受吗? 正常情况下,虽然我们一肚子火, 但是为了文章能发出去,还是会礼貌而克制地与审稿人进行交流, 但是,...

文章 加权基因共表达网络(WGCNA)寻找与疾病相关的hub基因

...库中的基因表达数据发表的文章,主要利用WGCNA的方法来筛选与癌症发生、发展相关的关键基因,从而发现区分不同癌症亚型的biomarker。看完文献可以说单单用了WGCNA的方法就发了篇paper:文献1:眼中葡萄膜黑色素恶性瘤基因共表...

文章 代谢组数据上传NGDC!简单又快捷!

...ac.cn/。进入后点"登录"注册账号。 使用邮箱注册,或者经有账号的直接登录,具体注册过程就不介绍了。 然后会进入到如下界面,点击"BioProject"创建新的BioProject。 这里会列出所有创建的BioProject,我们点击"新建BioProj...

文章 univariate_cox_batch.r 基因表达量批量单因素cox回归分析

...3 7.358566 3.769125 2.387869 2.37351 38.08591 8.305283 3.622781 7.025886 CX3CL1 603.0132 26.91353 20.22238 4.195262 19.04097 14.15295 13.75885 6.675374 4.050271 CEACAM21 1.868536 2.571917 0.610839 0.674558 1.092127 3.483559 1.134309 4.471274 0.58...

文章 Perl正则表达式

...的前一部分字符串$&: 匹配的字符串$': 还没有匹配的剩余字符串 如果将这三个变量放在一起,你将得到原始字符串。 实例如下: 实例 #!/usr/bin/perl   $string = "welcome to runoob site."; $string =~ m/run/; print "匹配前的字符串:$`\n"; ...

问题 老师我一个一个步骤进行,一个基因一个基因分析,是这个命令有问题才出现domain_final.bed只有一个基因,代码有问题么:grep -v '#' ZS11.v10.FAE1_hmmerOut.final.txt|awk 'BEGIN{OFS="\t"}$10==1 {print $1,$18,$19 }' >ZS11.v10.domain_final.bed,这是我刚刚使用的这步的代码,前一步产生的hmmerOut.final.txt文件还整常

如果代码没问题,只能手动筛选么,怎么保存成domain_final.bed格式呀

文章 转录组+sRNA+降解组=7分文章

...,在处理后不同时期发生表达量变化的miRNA有153个,改变筛选条件(丰度>10),有79个miRNA差异表达,其中67个为知的,12个为新的miRNA。通过表达谱热图可以看出同一家族的miRNA,绝大部分表达情况相似。新的miRNA有10个在Cd处理...

问题 老师我想问一下,MENA在analysis the network 报错的问题

...,"OTU1055","OTU1059","OTU106","OTU1064","OTU107","OTU1070","OTU1077","OTU1081","OTU1082","OTU109","OTU1090","OTU1094","OTU1098","OTU1099","OTU11","OTU111","OTU1110","OTU1112","OTU1118","OTU112","OTU1126","OTU1134","OTU1139","OTU114","OTU1141","OTU1146","OTU1148","OTU115","OTU1155","OTU116","OTU1166"...

文章 第7期-武汉站-《转录组结果解读与挖掘精讲班》邀您参加!

...89元的《转录组标准分析后数据挖掘19年版》视频课程;购买过该课程的学员,则按实际购买价折现予以优惠; 2. 团报优惠:2-3人,每人优惠200元;4人及以上每人优惠300元,与优惠1可叠加。 总有同学咨询基因家族分析类文...

文章 基因/蛋白序列结构图绘制-IBS的使用

...FOR DATABASE,目前只支持uniprot一个蛋白数据库,可以直接搜索蛋白质的ID进行绘图,不过小编体验了一下,目前网站存在故障未能运行,不过小编觉得上面2种方式就经够用了。 好了,IBS的绘图技能你get到了吗?动手试试吧! ...

文章 三分钟让你理解什么是敏捷开发,这才是敏捷开发......

...及测试。CORNERSTONE的甘特图功能可方便管理者弄清项目的剩余时间,评估工作进度,调整工作任务,更好地把握项目的整体。 2.2 站立会、周会 每日站立会以及周会是保证项目正常进行的手段之一,通过每天的站立会沟通,...

文章 DEG_limma.R 差异基因分析limma

...用引号引起来:"Stage IA" --fdr 0.05 --fc 2 设置差异基因的筛选条件:显著性和差异倍数(默认fdr=0.05,fold change=2) 使用举例: $$Rscript DEG_limma.R -e TCGA-ESCA_gene_expression_Counts.tsv \ > --fdr 0.05 --fc 2 -m metadata.group.tsv -t subtype.hclust ...

文章 2020年1-4月100+篇基因家族分析文献信息免费领取

...基因表达模式分析(结合转录组或QPCR数据); 近日小编搜索了下2020年1-4月期间在线发表的基因家族分析类文献,才发现原来短短3个多月就经发表了上百篇该类文章了,小编整理了其中100+篇成EXCEL,供大家参阅;此EXCEL包含...

文章 CAR-T质量检测ELISA试剂盒常见问题解析

...模取样后,可将样品分装,取一部分样品做ELISA预实验,剩余样品再进行正式实验;如多批次实验,操作较为一致,后续可取消预实验,根据前期结果进行ELISA实验浓度设置。   26、做实验前怎么知道待测血清中炎症因子的范围...