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文章 NCBI上传高通量测序数据到SRA数据库 aspera 支持续传

...x-linux-xx-release.sh 安装到自己的home目录下面： Aspera CLI in the ~/.aspera/cli directory. 2. 添加环境变量 $ export PATH=~/.aspera/cli/bin:$PATH 3. 添加说明文档，然后就可以使用了： $ export MANPATH=~/.aspera/cli/share/man:$MANPATH 下面是使用说明...

文章 使用MCscan进行多物种共线性分析与绘图

...)的 NRAMP 家族基因共线性图谱，如下图所示。 Tian et al.(2021) 今天我们仿照着该图片中所呈现的可视化结果进行一下上述8种植物基因组的共线性分析和绘图。希望大家通过这篇文章的学习也可以将自己分析的家族在不同物种之间...

文章 CAR-NK疗法：优势详解与应用前景

...殖，对冻融敏感性较低。   （5）可作为通用即用（Off-the-Shelf）产品。   基于NK细胞的高安全性，NK细胞疗法的一个巨大价值在于可作为通用即用产品，适用于不同个体、可长期冻存，能为危重患者提供及时的治疗，同时还能...

文章 国宝吃竹子并非发自内心-比较基因组学分析揭示大熊猫“心路历程”

... Q, Ma S, et al. Comparative genomics reveals convergent evolution between the bamboo-eating giant and red pandas[J]. Proc Natl Acad Sci U S A, 2017, 114(5):1081-1086.

文章 CAR-T质量检测ELISA试剂盒常见问题解析

...T质量检测相关ELISA试剂盒可以参看https://cn.sinobiological.com/research/car-t-therapy/t-cell-cytokine-elisa-kits

文章 论文“挑错”哪家强?中国学者64字diss柳叶刀论文，过于霸气!

... trial” 文章内容就不细说了， 最后这篇论文的作者Matthew Wilson等人的结论是：“与肌内注射哌替啶相比，瑞芬太尼患者自控镇痛使硬膜外转换的比例减半。” 按道理说能发布在柳叶刀(IF=59)这样的顶级期刊上的论文，应该是...

文章 免疫疫微环境（TIME）

...疫细胞并可视化。另外相关文章也是发表在了Nucleic Acids Research（IF=11.1）杂志上。 现有用于免疫浸润评估的算法可分为两大类：基于标记基因的肿瘤浸润免疫细胞量化方法和基于表达特征对细胞混合物进行反褶积的肿瘤浸...

文章 win10 安装最新的基于WSL2的docker

...dows，点击“设置”按钮，启用基于WSL2的引擎复选框（Use the WSL 2 based engine）在 Resources 的WSL Integration中设置要从哪个 WSL2 发行版中访问 Docker，如下图使用的是 Ubuntu。重启 Docker desktop for Windows，重启完成后我们就可以在 WSL2里面...

文章 《Science》：中国人诚信全球倒数第一？这个实验设计科学吗？

...， 后脚《Science》就刊发了一篇题目为《Civic honesty around the globe》的论文， 借助了统计学手段，研究全球公民的诚信情况。 按道理《Science》这么牛，那刊发的这个论文一定是经过层层审核，内容和实验设计一定是非常科学...

文章 已知目标基因，如何进行局部共线性绘图？

数据来源 我们今天的绘图流程和绘图数据来自一篇于2021年3月份发表在NG上的黑麦基因组文章“A high-quality genome assembly highlights rye genomic characteristics and agronomically important genes”，在这篇文章中，作者构建了一个高质量的威宁黑...

文章 linux目录结构详细讲解

...明或欢迎信息内容由系统管理员确定。/etc/motd Message Of The Day，成功登录后自动输出内容由系统管理员确定，经常用于通告信息，如计划关机时间的警告。/etc/mtab 当前安装的文件系统列表.由scripts初始化，并由mount 命令自动更新...

文章 相关系数小结

...要线性相关这个条件。 Kendall Tau is a statistic used to measure the ordinal association between two measured quantities.直接看公式比较容易理解： /2}) 即有序对儿(nc)的数量减去无序对儿(nd)的数量...

文章 批量修改进化树中的名称及添加分组名称

...   Aeropyrum pernix3702    Arabidopsis thaliana33169    Eremothecium gossypii222523    Bacillus cereus ATCC 109871423    Bacillus subtilis216816    Bifidobacterium longum 格式说明： 注释文件中以"#"开头的行是注释行，只起说明作用，iTOL不会...

文章 Linux安装细胞器组装软件--GetOrganelle

... #配置高等植物线粒体基因组库get_organelle_config.py --add other_pt            #配置其他植物质体基因组库get_organelle_config.py --add fungus_mt           #配置真菌线粒体基因组库get_organelle_config.py --add animal_mt          #配置动物线粒...

文章 NCBI批量下载数据,省时又省力

..._argument('-n','--name',default ='seq',required=False,help='Please specify the output, seq')args = parser.parse_args()dout=''if os.path.exists(args.out_dir):    dout=os.path.abspath(args.out_dir)else:    os.mkdir(args.out_dir)    dout=os.path.abspath(args.out_dir)output_handle = open(dout+'/'+...