...颜色来分的，且都是edges的文件。 代码用的是课程里下载的无性状代码： 十分感谢老师百忙之中的帮助！ 我用课程的数据做了下，前面的图都还正常，到了这个图，跟我用自己的数据做出来的样子差不多，跟正常图比起来有...
...prototype模式（analyze为正常使用模式） 于弹出框确定针对分析的序列类型，此选项和后续设置紧密相关 3、在上方工具栏选择进化树构建：PHYLOGENY，并选择基于某个模型进行建树 4、以NJ法为例，在弹出窗口中进行设置参数，...
...数 实际上是一个条件瞬间死亡率 。 基本原理 生存分析的主要目的在于研究变量X与观察结果即生存函数(累积生存率) 之间的关系。 当 受很多因素影响，即 为向量时...
老师您好，我分析的基因家族的一个成员是未挂载到染色体上（MdoScaf049s0015），但是进行共线性分析时，发现有两个成员和未挂载到染色体上（MdoScaf049s0015）的成员是大片段复制基因对（MdoChr03g1975:MdoScaf049s0015 MdoChr11g0239:MdoSca...
...进行同步监测。那么该如何进行蛋白质组和转录组的关联分析呢？ 首先，我们需要知道转录组和蛋白质组联合分析的目的是什么？ 1、对生物体特定状态下的基因和蛋白质表达水平进行全方位分析，或得一个表达谱的“全景图...
老师您好！我每次进行下图中OUT分析时，速度特别慢，我改用了blast分析（可能是速度慢的原因之一），同时我的qiime.fasta数据差不多是在300M（和老师教案中大小差不多），但是我速度太慢了，跑了将近一整天都跑不出来，也不...
keytype填ensembl，出现这样的提示，不知道什么原因啊？老师，填“TAIR”和“ENTREZID”都这样提示，
为什么做这步的时候说我的路径不存在？？？ 需要怎么处理啊？删掉重新做吗？昨天下面这步没做上，今天做的。
什么是WGCNA分析？ WGCNA分析的全称是加权基因共表达网络分析（Weighted correlation network analysis），是用来描述不同样品之间基因关联模式的生物信息学分析方法。可将表达模式相似的基因进行聚类，并分析模块与特定性状或表型...
水稻转录组数据绘制KEGG通路，显示 按照如下格式输入：（查找物种时，网页始终无法显示，水稻选osa不知道对不对，或者gene ID有问题）
在官方示例中，进行模块保守性检测，作者用了3600个雄鼠基因和雌鼠的3600个基因。我有两类样本，每一类样本都进行了WGCNA分析，若这两类样本基因数目不一致，还能进行模块保守型分析么？
...更深入，从本期起，小编给大家详细介绍下转录组实验及分析过程，里面肯定有你不知道的知识，赶紧get下吧！今天先介绍转录组建库原理。 RNA提取 转录组测得mRNA，提取却是提取的总RNA，只有质量合格的RNA，才会用来建库，...
老师您好！在进行ITS分析部分，我需要获得“rep_set.tre”文件进行alpha多样性分析（虽然您课程讲解了不建议生成该文件），但是出现了下图的报错（数据库我已经换成了unite），只生成了biom文件但是没生成“rep_set.tre”，请问是...
...程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，...
老师我做完图之后下面的物种为啥有两条染色体特别短，基本上不显示，但是他们的长度和其他的没有很大差别，是因为他们两条和另一个物种的没有相似的基因，所以长度都默认变小了吗