ITS测序的OTU聚类分析

老师您好！在进行ITS分析部分，我需要获得“rep_set.tre”文件进行alpha多样性分析（虽然您课程讲解了不建议生成该文件），但是出现了下图的报错（数据库我已经换成了unite），只生成了biom文件但是没生成“rep_set.tre”，请问是哪一步出错了，谢谢！

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2 个回答

omicsgene - 生物信息 2022-07-18 16:35

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

ITS没有16S 保守，不同种的菌 ITS差异大，无法构建进化树，所以报错；

啦啦啦种太阳 2022-07-18 19:32

老师您好，如果构建不了进化树，怎么进行后续的alpha多样性分析？谢谢！